182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6168 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0835  urease subunit alpha  82.45 
 
 
559 aa  854    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.893025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6168  Urease  100 
 
 
549 aa  1092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308489  normal  0.0462908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1552  urease  78.36 
 
 
557 aa  836    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  49.73 
 
 
568 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  46.15 
 
 
569 aa  492  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  46.5 
 
 
567 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  48.13 
 
 
571 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  47.74 
 
 
555 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  47.86 
 
 
573 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  47.58 
 
 
575 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  48.04 
 
 
573 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  46.87 
 
 
570 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  44.96 
 
 
576 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  46.59 
 
 
567 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  49.73 
 
 
571 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  47.23 
 
 
575 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  46.07 
 
 
570 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0392  urease subunit alpha  45.12 
 
 
585 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  46.59 
 
 
569 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64390  urease subunit alpha  47.68 
 
 
566 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5589  urease subunit alpha  47.86 
 
 
566 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  44.4 
 
 
573 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  46.17 
 
 
572 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  47.6 
 
 
573 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  47.41 
 
 
568 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  46.79 
 
 
569 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  42.04 
 
 
570 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  47.23 
 
 
568 aa  475  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  45.45 
 
 
572 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  45.45 
 
 
572 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  47.05 
 
 
569 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  45.45 
 
 
572 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  45.99 
 
 
572 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  44.39 
 
 
572 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  47.23 
 
 
568 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  47.22 
 
 
568 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  45.96 
 
 
566 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  46.42 
 
 
567 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  50.18 
 
 
571 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  46.52 
 
 
570 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  47.22 
 
 
569 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  47.33 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  46.59 
 
 
564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  46.24 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  46.06 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  46.42 
 
 
564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  45.08 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  45.08 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  46.42 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  45.99 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  44.9 
 
 
575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  46.42 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  44.64 
 
 
570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  46.42 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  45.81 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  46.24 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03440  urease subunit alpha  45.63 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  45.81 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  45.99 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  46.42 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  46.59 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  44.62 
 
 
569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  46.42 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  45.18 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2610  urease  49.46 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  46.15 
 
 
570 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  45.96 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  46.25 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  45.89 
 
 
566 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  45.62 
 
 
570 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  45.08 
 
 
570 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  45.99 
 
 
570 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  44.82 
 
 
570 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  44.74 
 
 
878 aa  463  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  47.4 
 
 
569 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  46.77 
 
 
567 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  46.8 
 
 
572 aa  465  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  45.52 
 
 
569 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  45.62 
 
 
575 aa  465  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  43.34 
 
 
573 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  44.82 
 
 
571 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  46.06 
 
 
568 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  44.9 
 
 
570 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  45.34 
 
 
569 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  45.68 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  47.04 
 
 
569 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  44.29 
 
 
569 aa  460  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09880  urease subunit alpha  46.07 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  45.08 
 
 
567 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  45.54 
 
 
570 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1726  urease subunit alpha  46.03 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192179  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  45.26 
 
 
570 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1558  urease, alpha subunit  46.44 
 
 
568 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  46.32 
 
 
567 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  46.8 
 
 
572 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>