199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1197 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  55.71 
 
 		 570 aa  651    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  100 
 
 		 570 aa  1162    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  77.37 
 
 		 570 aa  915    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  57.82 
 
 		 569 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  59.05 
 
 		 568 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  58.38 
 
 		 569 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  56.22 
 
 		 575 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  57.89 
 
 		 569 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1558  urease, alpha subunit  59.15 
 
 		 568 aa  671    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  56.12 
 
 		 570 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  58.84 
 
 		 573 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  58.38 
 
 		 571 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  57.37 
 
 		 570 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  95.79 
 
 		 570 aa  1116    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  56.92 
 
 		 575 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  57.19 
 
 		 569 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0057  urease subunit alpha  60.74 
 
 		 571 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  56.57 
 
 		 878 aa  638    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  57.97 
 
 		 572 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  99.47 
 
 		 570 aa  1158    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  64.73 
 
 		 571 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  98.6 
 
 		 570 aa  1149    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  59.58 
 
 		 569 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  55.34 
 
 		 573 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  86.32 
 
 		 569 aa  1017    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  60.18 
 
 		 571 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  55.94 
 
 		 571 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  56.14 
 
 		 570 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  57.29 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 570 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  56.1 
 
 		 573 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  55.34 
 
 		 567 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  56.61 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  55.05 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  55.59 
 
 		 570 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  54.91 
 
 		 570 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3939  urease subunit alpha  57.41 
 
 		 583 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  55.69 
 
 		 575 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1041  urease subunit alpha  55.77 
 
 		 570 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0392  urease subunit alpha  54.72 
 
 		 585 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2184  urease subunit alpha  56.27 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  56.45 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 569 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  57.29 
 
 		 569 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  57.79 
 
 		 568 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  57.47 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  56.92 
 
 		 574 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  56.29 
 
 		 568 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  57.02 
 
 		 570 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  57.67 
 
 		 568 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  56.39 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  56.57 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 564 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  54.72 
 
 		 567 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3204  urease, alpha subunit  56.17 
 
 		 574 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00573416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  55.52 
 
 		 575 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 564 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  56.39 
 
 		 566 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  54.56 
 
 		 570 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  55.59 
 
 		 567 aa  621  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  55.54 
 
 		 572 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09880  urease subunit alpha  56.57 
 
 		 566 aa  621  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  56.06 
 
 		 575 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  54.91 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  54.74 
 
 		 570 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1861  urease subunit alpha  56.1 
 
 		 572 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6441  urease subunit alpha  56.48 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.170018  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  55.26 
 
 		 570 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  55.24 
 
 		 567 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  56.22 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 568 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  56.62 
 
 		 572 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1323  urease subunit alpha  56.2 
 
 		 567 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  55.69 
 
 		 566 aa  618  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  55.96 
 
 		 570 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  54.39 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  56 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  54.21 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4417  urease subunit alpha  54.28 
 
 		 586 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  55.24 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  55.52 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  57.19 
 
 		 562 aa  615  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>