200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2610 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2610  urease  100 
 
 
562 aa  1120    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2767  Urease  81.49 
 
 
548 aa  883    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.18111  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1552  urease  52.5 
 
 
557 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  47.05 
 
 
569 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  47.64 
 
 
570 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  45.68 
 
 
567 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  47.64 
 
 
570 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  47.46 
 
 
570 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  47.01 
 
 
568 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  45.17 
 
 
572 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  48.23 
 
 
571 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4442  urease subunit alpha  48.14 
 
 
568 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508475  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  45.33 
 
 
567 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  47.64 
 
 
570 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  45.25 
 
 
568 aa  485  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  46.32 
 
 
569 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  46.17 
 
 
572 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  45.74 
 
 
573 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  45.58 
 
 
570 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  46.34 
 
 
572 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  43.74 
 
 
567 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  45.58 
 
 
569 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  45.99 
 
 
572 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  46.41 
 
 
570 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  45.39 
 
 
569 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  44.8 
 
 
568 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3939  urease subunit alpha  46.17 
 
 
583 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  47.54 
 
 
571 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  47.45 
 
 
571 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  45.75 
 
 
575 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  46.02 
 
 
567 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  45.03 
 
 
569 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  45.12 
 
 
566 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6168  Urease  48.92 
 
 
549 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308489  normal  0.0462908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  45.03 
 
 
572 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  43.66 
 
 
571 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  44.8 
 
 
570 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  45.03 
 
 
572 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  45.04 
 
 
569 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  43.92 
 
 
570 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  45.44 
 
 
570 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  46.81 
 
 
555 aa  475  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  43.66 
 
 
571 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  43.31 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  45.68 
 
 
569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  45.33 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  46.65 
 
 
564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0392  urease subunit alpha  43.91 
 
 
585 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  44.99 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  44.42 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  44.44 
 
 
570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  45.34 
 
 
569 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  45.16 
 
 
575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  46.65 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  44.01 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  45.14 
 
 
573 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  46.48 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  45.5 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  46.48 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  46.74 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  45.57 
 
 
569 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1323  urease subunit alpha  45.01 
 
 
567 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  45.33 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  45.42 
 
 
575 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  45.88 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  46.48 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  46.48 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  46.3 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  46.48 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  45.71 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4222  urease subunit alpha  45.22 
 
 
588 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332546  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  44.46 
 
 
570 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  45.31 
 
 
573 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1704  urease, alpha subunit  46.29 
 
 
569 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469415 
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  43.92 
 
 
570 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  44.56 
 
 
567 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  41.93 
 
 
569 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  44.06 
 
 
568 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  45.2 
 
 
572 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  44.8 
 
 
570 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  41.93 
 
 
569 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  44.83 
 
 
574 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  44.35 
 
 
568 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3504  urease, alpha subunit  47.64 
 
 
572 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  45.44 
 
 
572 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2417  urease subunit alpha  45.71 
 
 
567 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254104  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  45.39 
 
 
569 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0832  urease subunit alpha  45 
 
 
575 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  45.07 
 
 
568 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2715  Urease  45.31 
 
 
574 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  44.43 
 
 
573 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  45.17 
 
 
567 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  44.54 
 
 
575 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0506  urease subunit alpha  45.63 
 
 
565 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  43.53 
 
 
573 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>