184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4442 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4442  urease subunit alpha  100 
 
 		 568 aa  1165    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  54.91 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  52.81 
 
 		 570 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  52.46 
 
 		 570 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  52.28 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  52.46 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  51.23 
 
 		 569 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  49.82 
 
 		 569 aa  555  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  47.89 
 
 		 570 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  50 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  47.89 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  47.63 
 
 		 573 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  50.97 
 
 		 569 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  50.09 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  49.03 
 
 		 567 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  49.13 
 
 		 570 aa  541  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  49.91 
 
 		 569 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  48.61 
 
 		 567 aa  539  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  49.03 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  49.3 
 
 		 570 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  49.38 
 
 		 569 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  48.95 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  48.69 
 
 		 878 aa  538  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  49.74 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  49.3 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  48.95 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  48.95 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  48.08 
 
 		 570 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  48.43 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  49.83 
 
 		 575 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  49.03 
 
 		 569 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  47.02 
 
 		 570 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  49.12 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  49.38 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  49.03 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 566 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  48.16 
 
 		 569 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  48.95 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  48.78 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  49.83 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  49.12 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  48.78 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  49.12 
 
 		 572 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  49.13 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0057  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  49.38 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  50 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  50 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  46.92 
 
 		 572 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  48.78 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4243  urease subunit alpha  49.48 
 
 		 572 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  50 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  49.04 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  49.38 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  48.78 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  49.91 
 
 		 568 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  48.6 
 
 		 575 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  48.25 
 
 		 570 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  49.65 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  47.37 
 
 		 570 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  49.65 
 
 		 568 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  47.13 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  48.78 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  48.94 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  47.54 
 
 		 571 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1323  urease subunit alpha  47.9 
 
 		 567 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  47.64 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  47.47 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  47.72 
 
 		 570 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  49.65 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  47.72 
 
 		 570 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  48.77 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  47.11 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2260  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  47.2 
 
 		 570 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3204  urease, alpha subunit  47.22 
 
 		 574 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00573416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  49.21 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  47.8 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2715  Urease  46.96 
 
 		 574 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  48.95 
 
 		 562 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  48.44 
 
 		 572 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  47.38 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  44.99 
 
 		 833 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  48.35 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  46.92 
 
 		 568 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1241  urease subunit alpha  47.98 
 
 		 568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  48.09 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  47.81 
 
 		 571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  48.43 
 
 		 570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  48.86 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  46.57 
 
 		 569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  49.74 
 
 		 568 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  47.99 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1193  urease subunit alpha  47.9 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.896541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  48.43 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  45.64 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2849  urease subunit alpha  48.18 
 
 		 573 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>