198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2365 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  61.47 
 
 		 836 aa  706    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2845  urease subunit alpha  67.79 
 
 		 567 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0747373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  56.39 
 
 		 571 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  71.03 
 
 		 572 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  64.04 
 
 		 570 aa  780    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  74.39 
 
 		 570 aa  892    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5589  urease subunit alpha  70.97 
 
 		 566 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  56.06 
 
 		 573 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  70.8 
 
 		 566 aa  814    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 568 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  59.96 
 
 		 833 aa  705    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  70.02 
 
 		 567 aa  818    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  71.15 
 
 		 566 aa  817    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  72.81 
 
 		 569 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  70.12 
 
 		 569 aa  816    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  71.7 
 
 		 571 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  69.42 
 
 		 568 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  71.18 
 
 		 568 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  70.44 
 
 		 564 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  72.04 
 
 		 566 aa  823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  72.21 
 
 		 566 aa  832    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  67.25 
 
 		 571 aa  780    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  79.96 
 
 		 568 aa  951    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  69.42 
 
 		 568 aa  806    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  73.46 
 
 		 569 aa  842    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  73.11 
 
 		 569 aa  843    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  69.95 
 
 		 569 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1241  urease subunit alpha  69.07 
 
 		 568 aa  775    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  70.62 
 
 		 564 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0832  urease subunit alpha  60.87 
 
 		 575 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  74.74 
 
 		 570 aa  899    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  86.47 
 
 		 569 aa  1024    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3402  urease subunit alpha  71.72 
 
 		 581 aa  816    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.889558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  72.18 
 
 		 568 aa  816    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  76.14 
 
 		 570 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  70.47 
 
 		 567 aa  807    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  56.99 
 
 		 572 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  70.58 
 
 		 572 aa  813    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  69.77 
 
 		 568 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  73.59 
 
 		 570 aa  866    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11878  urease subunit alpha  60.59 
 
 		 577 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.131884  normal  0.459412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  75.61 
 
 		 570 aa  911    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 570 aa  795    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  64.84 
 
 		 567 aa  758    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0986  urease subunit alpha  64.93 
 
 		 630 aa  783    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  71.55 
 
 		 572 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  84.74 
 
 		 570 aa  1008    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  69.77 
 
 		 568 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2805  urease subunit alpha  61.65 
 
 		 573 aa  721    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  82.46 
 
 		 570 aa  985    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1261  urease subunit alpha  65.21 
 
 		 570 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246946  normal  0.705398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  70.88 
 
 		 570 aa  819    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  73.81 
 
 		 568 aa  835    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  69.24 
 
 		 568 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64390  urease subunit alpha  70.97 
 
 		 566 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0325  urease subunit alpha  56.47 
 
 		 572 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.60778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  64.76 
 
 		 576 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  69.77 
 
 		 568 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  76.8 
 
 		 569 aa  898    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  75.04 
 
 		 562 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2849  urease subunit alpha  61.65 
 
 		 573 aa  721    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  69.84 
 
 		 567 aa  805    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3082  urease subunit alpha  60.77 
 
 		 573 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0821561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  70.9 
 
 		 567 aa  788    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  72.5 
 
 		 572 aa  838    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  71.63 
 
 		 572 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 568 aa  804    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5695  urease subunit alpha  61.26 
 
 		 575 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1726  urease subunit alpha  69.27 
 
 		 590 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  69.77 
 
 		 569 aa  816    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 569 aa  817    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  71.08 
 
 		 574 aa  819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  69.86 
 
 		 575 aa  803    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 568 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  67.66 
 
 		 572 aa  795    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  79.96 
 
 		 568 aa  951    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  70.12 
 
 		 568 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  69.77 
 
 		 568 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2832  urease subunit alpha  61.65 
 
 		 573 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.887155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  70.3 
 
 		 568 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08931  urease subunit alpha  69.95 
 
 		 569 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  63.68 
 
 		 570 aa  767    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3352  urease subunit alpha  60.42 
 
 		 573 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.669809  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  63.62 
 
 		 840 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1193  urease subunit alpha  70.9 
 
 		 567 aa  826    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.896541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  78.25 
 
 		 570 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  79.79 
 
 		 568 aa  947    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3466  urease subunit alpha  68.08 
 
 		 567 aa  788    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0139637  normal  0.238388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  71.86 
 
 		 566 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  66.37 
 
 		 569 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  66.32 
 
 		 573 aa  798    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  100 
 
 		 569 aa  1170    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  75.26 
 
 		 570 aa  903    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  76.01 
 
 		 571 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  57.79 
 
 		 571 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0284  urease subunit alpha  72.81 
 
 		 560 aa  864    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.346246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  57.79 
 
 		 571 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  55.89 
 
 		 573 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  67.43 
 
 		 567 aa  778    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2844  urease subunit alpha  67.61 
 
 		 567 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.438037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>