197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2065 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  57.17 
 
 
575 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2845  urease subunit alpha  58.04 
 
 
567 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0747373  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  54.2 
 
 
571 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  58.52 
 
 
568 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  56.64 
 
 
570 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  54.74 
 
 
570 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  57.72 
 
 
570 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  56.99 
 
 
570 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  60.63 
 
 
573 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  57.47 
 
 
566 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  57.79 
 
 
570 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  59.23 
 
 
568 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  58.99 
 
 
572 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  57.47 
 
 
566 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  58.35 
 
 
569 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  59.58 
 
 
569 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  57.29 
 
 
571 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  58.52 
 
 
568 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  59.4 
 
 
564 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  57.64 
 
 
566 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  56.94 
 
 
566 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  57.09 
 
 
568 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  59.4 
 
 
568 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  60.46 
 
 
569 aa  686    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  59.93 
 
 
569 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  56.77 
 
 
569 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  59.75 
 
 
568 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  59.75 
 
 
564 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2417  urease subunit alpha  58.92 
 
 
567 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254104  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  54.91 
 
 
570 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  55.73 
 
 
569 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3402  urease subunit alpha  56.95 
 
 
581 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.889558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  57.77 
 
 
568 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  54.93 
 
 
570 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  57.47 
 
 
567 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  56.27 
 
 
572 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  58.17 
 
 
568 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  54.56 
 
 
570 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  57.62 
 
 
570 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  57.37 
 
 
567 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  56.33 
 
 
575 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  61.15 
 
 
572 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  55.69 
 
 
570 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  59.75 
 
 
568 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2935  urease subunit alpha  58.04 
 
 
567 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19721  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  58.99 
 
 
572 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  57.17 
 
 
570 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  59.4 
 
 
568 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  57.89 
 
 
570 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  58.88 
 
 
568 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  56.82 
 
 
570 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  59.4 
 
 
568 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  58.95 
 
 
571 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  59.23 
 
 
568 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  57.64 
 
 
576 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  59.75 
 
 
568 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  57.37 
 
 
569 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  57.54 
 
 
562 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1041  urease subunit alpha  56.22 
 
 
570 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  56.99 
 
 
575 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  57.52 
 
 
567 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  60.98 
 
 
572 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  58.95 
 
 
567 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  57.84 
 
 
572 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  56.62 
 
 
572 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  59.23 
 
 
568 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1726  urease subunit alpha  55.91 
 
 
590 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192179  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  56.77 
 
 
569 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  59.75 
 
 
569 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  58.89 
 
 
574 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  56.33 
 
 
575 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  59.23 
 
 
568 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  59.82 
 
 
572 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  57.09 
 
 
568 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  59.4 
 
 
568 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  59.05 
 
 
568 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  56.82 
 
 
570 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  59.23 
 
 
568 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08931  urease subunit alpha  55.89 
 
 
569 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4222  urease subunit alpha  58.49 
 
 
588 aa  669    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332546  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  58.39 
 
 
567 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  58.22 
 
 
567 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  56.29 
 
 
570 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  57.09 
 
 
568 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3466  urease subunit alpha  57.17 
 
 
567 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0139637  normal  0.238388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  56.06 
 
 
566 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  58.99 
 
 
572 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  59.72 
 
 
573 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2260  urease subunit alpha  58.35 
 
 
568 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  56.39 
 
 
569 aa  658    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  54.82 
 
 
571 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  58.64 
 
 
568 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  54.2 
 
 
571 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  55.09 
 
 
570 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  60.98 
 
 
573 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  54.2 
 
 
571 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  56.77 
 
 
571 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  59.27 
 
 
567 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2844  urease subunit alpha  57.87 
 
 
567 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.438037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  60.32 
 
 
569 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>