176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1358 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  56.22 
 
 		 570 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2845  urease subunit alpha  56.47 
 
 		 567 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0747373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4222  urease subunit alpha  56.07 
 
 		 588 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332546  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  55.75 
 
 		 572 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  56.84 
 
 		 570 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  55.87 
 
 		 570 aa  666    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  100 
 
 		 573 aa  1174    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  59.47 
 
 		 566 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 568 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  54.31 
 
 		 570 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  59.47 
 
 		 566 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 569 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 569 aa  661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  56.77 
 
 		 571 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  55.44 
 
 		 568 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 564 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  56.67 
 
 		 566 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  58.42 
 
 		 566 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  56.84 
 
 		 568 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  57.72 
 
 		 569 aa  669    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  57.89 
 
 		 569 aa  670    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 569 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1241  urease subunit alpha  56.14 
 
 		 568 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 564 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2260  urease subunit alpha  55.79 
 
 		 568 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  55.42 
 
 		 570 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  55.52 
 
 		 569 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  55.26 
 
 		 575 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  56.54 
 
 		 568 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  56.39 
 
 		 570 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  55.26 
 
 		 567 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  54.09 
 
 		 572 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  56.84 
 
 		 568 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  55.52 
 
 		 570 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  55.94 
 
 		 570 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  55.87 
 
 		 567 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0986  urease subunit alpha  52 
 
 		 630 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  56.27 
 
 		 572 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  54.48 
 
 		 570 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  57.02 
 
 		 568 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  56.04 
 
 		 575 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  57.44 
 
 		 570 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  69.06 
 
 		 572 aa  837    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  55.69 
 
 		 570 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  58.14 
 
 		 568 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64390  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 566 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0325  urease subunit alpha  54.55 
 
 		 572 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.60778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  56.6 
 
 		 576 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  57.02 
 
 		 568 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  57.12 
 
 		 569 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 568 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  55.15 
 
 		 567 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  57.02 
 
 		 568 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  56.22 
 
 		 567 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  55.13 
 
 		 572 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  54.96 
 
 		 572 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2184  urease subunit alpha  55.75 
 
 		 572 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  55.26 
 
 		 569 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 569 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  55.3 
 
 		 574 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  56.67 
 
 		 568 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  55.96 
 
 		 572 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  56.41 
 
 		 568 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 568 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  69.06 
 
 		 572 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  56.49 
 
 		 568 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08931  urease subunit alpha  55.44 
 
 		 569 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  55.59 
 
 		 570 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  55.87 
 
 		 570 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2417  urease subunit alpha  56.12 
 
 		 567 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  57.34 
 
 		 567 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1193  urease subunit alpha  55.07 
 
 		 567 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.896541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 568 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3466  urease subunit alpha  54.37 
 
 		 567 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0139637  normal  0.238388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  58.25 
 
 		 566 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  58.52 
 
 		 569 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  56.04 
 
 		 573 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  69.11 
 
 		 572 aa  837    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  56.06 
 
 		 569 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  55.94 
 
 		 571 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  68.76 
 
 		 572 aa  836    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0284  urease subunit alpha  54.64 
 
 		 560 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.346246  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  99.65 
 
 		 573 aa  1170    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2844  urease subunit alpha  56.29 
 
 		 567 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.438037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2935  urease subunit alpha  56.29 
 
 		 567 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  55.94 
 
 		 570 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  55.87 
 
 		 570 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  56.04 
 
 		 568 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5589  urease subunit alpha  55.61 
 
 		 566 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1041  urease subunit alpha  55.96 
 
 		 570 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  56.04 
 
 		 570 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  57.69 
 
 		 567 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  56.32 
 
 		 571 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  69.06 
 
 		 572 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>