188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1193 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  65.14 
 
 
836 aa  735    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2845  urease subunit alpha  72.31 
 
 
567 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0747373  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  60.21 
 
 
571 aa  717    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  85.06 
 
 
572 aa  995    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  64.55 
 
 
570 aa  768    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  71.3 
 
 
570 aa  842    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  70.9 
 
 
567 aa  833    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  55.07 
 
 
573 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  80 
 
 
566 aa  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  79.47 
 
 
568 aa  923    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  60.92 
 
 
833 aa  715    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  79.82 
 
 
566 aa  920    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  79.51 
 
 
569 aa  914    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  71.43 
 
 
569 aa  815    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  82.14 
 
 
571 aa  966    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5589  urease subunit alpha  78.09 
 
 
566 aa  894    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  73.14 
 
 
568 aa  833    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  79.61 
 
 
564 aa  921    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  72.21 
 
 
566 aa  836    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  79.29 
 
 
566 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  69.66 
 
 
568 aa  816    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  80 
 
 
568 aa  938    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  71.55 
 
 
569 aa  823    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  71.38 
 
 
569 aa  820    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  74.07 
 
 
570 aa  881    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  70.49 
 
 
569 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1241  urease subunit alpha  73.45 
 
 
568 aa  841    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  73.06 
 
 
570 aa  857    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  79.08 
 
 
564 aa  920    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0832  urease subunit alpha  60.59 
 
 
575 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  73.9 
 
 
570 aa  881    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  71.02 
 
 
569 aa  842    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3402  urease subunit alpha  73.67 
 
 
581 aa  853    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.889558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  76.76 
 
 
568 aa  902    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  74.78 
 
 
570 aa  898    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  78.23 
 
 
567 aa  909    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  75.52 
 
 
572 aa  880    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  80.35 
 
 
568 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  72.71 
 
 
568 aa  857    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  74.6 
 
 
570 aa  886    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  72.39 
 
 
570 aa  841    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  69.43 
 
 
567 aa  830    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0986  urease subunit alpha  67.79 
 
 
630 aa  830    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  82.78 
 
 
572 aa  971    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  71.13 
 
 
570 aa  844    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  80.18 
 
 
568 aa  939    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2805  urease subunit alpha  60.8 
 
 
573 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  70.95 
 
 
570 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  74.47 
 
 
570 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1261  urease subunit alpha  69.01 
 
 
570 aa  771    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246946  normal  0.705398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  71.13 
 
 
570 aa  809    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  75.04 
 
 
568 aa  879    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  79.82 
 
 
568 aa  938    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64390  urease subunit alpha  78.09 
 
 
566 aa  894    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170312  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0325  urease subunit alpha  56.77 
 
 
572 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.60778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  64.57 
 
 
576 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  80.18 
 
 
568 aa  939    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  74.51 
 
 
569 aa  887    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  69.96 
 
 
562 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2849  urease subunit alpha  60.8 
 
 
573 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429572  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  73.37 
 
 
567 aa  853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3082  urease subunit alpha  61.15 
 
 
573 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0821561  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  74.38 
 
 
567 aa  846    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  74.13 
 
 
572 aa  871    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  75 
 
 
572 aa  879    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  79.47 
 
 
568 aa  923    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1726  urease subunit alpha  69.66 
 
 
590 aa  827    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192179  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  69.96 
 
 
569 aa  799    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  71.43 
 
 
569 aa  814    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  71.45 
 
 
574 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  72.87 
 
 
575 aa  862    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  79.47 
 
 
568 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  68.01 
 
 
572 aa  811    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  69.66 
 
 
568 aa  816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  79.47 
 
 
568 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  79.65 
 
 
568 aa  925    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2832  urease subunit alpha  60.8 
 
 
573 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.887155  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  79.47 
 
 
568 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08931  urease subunit alpha  69.61 
 
 
569 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  64.49 
 
 
570 aa  758    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3352  urease subunit alpha  61.32 
 
 
573 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.669809  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  62.5 
 
 
840 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1193  urease subunit alpha  100 
 
 
567 aa  1173    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.896541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  69.66 
 
 
568 aa  817    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3466  urease subunit alpha  72.84 
 
 
567 aa  851    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0139637  normal  0.238388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  79.51 
 
 
566 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  69.61 
 
 
569 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  66.84 
 
 
573 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  83.6 
 
 
567 aa  989    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  70.9 
 
 
569 aa  846    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  57.44 
 
 
572 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  73.59 
 
 
571 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  60.39 
 
 
571 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0284  urease subunit alpha  69.54 
 
 
560 aa  815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.346246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5695  urease subunit alpha  61.28 
 
 
575 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  55.42 
 
 
573 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  66.9 
 
 
571 aa  777    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2844  urease subunit alpha  72.49 
 
 
567 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.438037  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11878  urease subunit alpha  61.01 
 
 
577 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.131884  normal  0.459412 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  60.39 
 
 
571 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>