232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0887 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  100 
 
 		 555 aa  1134    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  57.59 
 
 		 572 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  56.7 
 
 		 570 aa  631  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  56.99 
 
 		 573 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3204  urease, alpha subunit  56.9 
 
 		 574 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00573416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0506  urease subunit alpha  56.28 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4222  urease subunit alpha  55.27 
 
 		 588 aa  623  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332546  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1208  urease subunit alpha  55.71 
 
 		 562 aa  621  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  56.06 
 
 		 569 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6441  urease subunit alpha  56.15 
 
 		 577 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.170018  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  55.46 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  56.24 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  54.82 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  54.5 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2755  urease, alpha subunit  54.9 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0640489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  55.63 
 
 		 569 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  56.74 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0832  urease subunit alpha  55.75 
 
 		 575 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  54.13 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  56.59 
 
 		 570 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0191  urease, alpha subunit  55.59 
 
 		 573 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  54.93 
 
 		 575 aa  611  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  55.91 
 
 		 568 aa  609  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  55.56 
 
 		 569 aa  611  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2805  urease subunit alpha  54.99 
 
 		 573 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32745  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  54.32 
 
 		 570 aa  611  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  54.4 
 
 		 571 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2849  urease subunit alpha  54.99 
 
 		 573 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  53.89 
 
 		 878 aa  609  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2832  urease subunit alpha  54.99 
 
 		 573 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.887155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2715  Urease  55.92 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  53.58 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  54.13 
 
 		 571 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  53.6 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  53.68 
 
 		 572 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  54.39 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  54.23 
 
 		 575 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  53.85 
 
 		 573 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3082  urease subunit alpha  53.9 
 
 		 573 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0821561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  53.95 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3352  urease subunit alpha  53.9 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.669809  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  52.56 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  53.43 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  55.2 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  54.13 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  53.33 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  53.25 
 
 		 570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  53.51 
 
 		 572 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  53.35 
 
 		 570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  52.28 
 
 		 833 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  53.26 
 
 		 568 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  52.72 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  54.36 
 
 		 574 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  53.26 
 
 		 568 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  53.71 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  53.75 
 
 		 575 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  52.89 
 
 		 571 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11878  urease subunit alpha  54.56 
 
 		 577 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.131884  normal  0.459412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  52.37 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  53.43 
 
 		 570 aa  598  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  52.99 
 
 		 568 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  52.89 
 
 		 571 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  53.6 
 
 		 570 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  53.7 
 
 		 569 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  54.13 
 
 		 570 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1041  urease subunit alpha  54.4 
 
 		 570 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  55.56 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  53.06 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0392  urease subunit alpha  51.88 
 
 		 585 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  53.06 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  53.6 
 
 		 570 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  53.06 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08931  urease subunit alpha  53.43 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  51.75 
 
 		 571 aa  589  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  52.29 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  51.75 
 
 		 573 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  53.97 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  52.11 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  52.11 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  52.18 
 
 		 573 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5695  urease subunit alpha  53.54 
 
 		 575 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  51.58 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  52.34 
 
 		 576 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0697  urease, alpha subunit  54.23 
 
 		 567 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0322329  unclonable  0.00000000391101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1704  urease, alpha subunit  54.69 
 
 		 569 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  55.01 
 
 		 566 aa  586  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03440  urease subunit alpha  52.36 
 
 		 571 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  54.58 
 
 		 568 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  54.48 
 
 		 569 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  54.32 
 
 		 567 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  54.5 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1323  urease subunit alpha  52.55 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  54.56 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  54.21 
 
 		 568 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  54.48 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1261  urease subunit alpha  53.6 
 
 		 570 aa  578  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246946  normal  0.705398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  55.09 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  54.13 
 
 		 568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  54.82 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  53.6 
 
 		 840 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>