176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0835 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1552  urease  78.52 
 
 		 557 aa  851    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6168  Urease  82.45 
 
 		 549 aa  858    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308489  normal  0.0462908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0835  urease subunit alpha  100 
 
 		 559 aa  1110    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.893025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  46.65 
 
 		 567 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  46.6 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  47.98 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  46.77 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  47.2 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  48.17 
 
 		 573 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  46.85 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  46.26 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1133  urease subunit alpha  45.28 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  45.28 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  47.45 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  48.04 
 
 		 575 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  46.68 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  44.82 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  47.54 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1079  urease subunit alpha  45.28 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  47.45 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  46.4 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  48.06 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  45.95 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  45.17 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  47.62 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  45.87 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  46 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  47.15 
 
 		 569 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  49.47 
 
 		 571 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  47.54 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  46.83 
 
 		 568 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  48.3 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  46.95 
 
 		 575 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  46.8 
 
 		 570 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  46.71 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  45.91 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  44.84 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  46.47 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  45.69 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  44.56 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  47.43 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  47.44 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  47 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  46.57 
 
 		 575 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  46.3 
 
 		 568 aa  482  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  47.27 
 
 		 569 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  47 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  46.5 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  47 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  46.3 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  47 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3112  urease subunit alpha  46.82 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  47 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  46.47 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  45.1 
 
 		 569 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  45.45 
 
 		 569 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3135  urease subunit alpha  47.14 
 
 		 564 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4182  urease subunit alpha  44.99 
 
 		 570 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  46.01 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1726  urease subunit alpha  46.36 
 
 		 590 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  45.91 
 
 		 570 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  45.63 
 
 		 569 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2365  urease subunit alpha  44.92 
 
 		 569 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2184  urease subunit alpha  47.26 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03440  urease subunit alpha  46.47 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  45.94 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  44.94 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  45.2 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  44.7 
 
 		 573 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  45.41 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  46.61 
 
 		 564 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  43.74 
 
 		 569 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  47.32 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  45.58 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  45.58 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  45.2 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1861  urease subunit alpha  46.73 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  45.76 
 
 		 568 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  45.58 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  45.77 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  45.76 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  45.39 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  41.37 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  45.18 
 
 		 570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  47.16 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  45.83 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  45.87 
 
 		 568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  45.28 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  46.55 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64390  urease subunit alpha  45.54 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  45.36 
 
 		 576 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3529  urease subunit alpha  46.42 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  44.78 
 
 		 878 aa  471  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  47.16 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  47.02 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0284  urease subunit alpha  43.94 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.346246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  47.16 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  45.17 
 
 		 568 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5589  urease subunit alpha  45.71 
 
 		 566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  48.77 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>