223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5127 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  54.02 
 
 		 1005 aa  1067    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  40.9 
 
 		 1024 aa  678    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  41.78 
 
 		 1024 aa  698    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  41.72 
 
 		 1024 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  47.64 
 
 		 988 aa  897    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  100 
 
 		 1010 aa  2093    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  41.33 
 
 		 1024 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  39.37 
 
 		 1018 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  40.24 
 
 		 1010 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  39.25 
 
 		 1046 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  43.05 
 
 		 1029 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  61.73 
 
 		 1020 aa  1277    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  41.93 
 
 		 1029 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  40.43 
 
 		 1021 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  44.39 
 
 		 839 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  41.54 
 
 		 1029 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  44.68 
 
 		 763 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  53.41 
 
 		 908 aa  562  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  52.7 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  46.08 
 
 		 441 aa  334  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  43.43 
 
 		 461 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  41.48 
 
 		 1498 aa  310  8e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.89 
 
 		 475 aa  245  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  36.68 
 
 		 471 aa  241  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  35.42 
 
 		 470 aa  231  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.58 
 
 		 525 aa  228  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  37.07 
 
 		 464 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.08 
 
 		 460 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  32.6 
 
 		 560 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  35.61 
 
 		 469 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  29.72 
 
 		 388 aa  187  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  30.9 
 
 		 379 aa  177  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.73 
 
 		 402 aa  174  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  31.57 
 
 		 384 aa  172  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  31.57 
 
 		 386 aa  172  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  29.31 
 
 		 420 aa  171  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  32.15 
 
 		 386 aa  169  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  29.4 
 
 		 385 aa  169  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  31.27 
 
 		 397 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  30.56 
 
 		 386 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  30.95 
 
 		 383 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.95 
 
 		 412 aa  164  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  28.43 
 
 		 389 aa  162  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  29.92 
 
 		 384 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  29.22 
 
 		 403 aa  159  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.52 
 
 		 402 aa  160  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  30.77 
 
 		 385 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  28.61 
 
 		 429 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  29.38 
 
 		 385 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  29.31 
 
 		 396 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  28.06 
 
 		 396 aa  154  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  30.13 
 
 		 424 aa  154  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  32.1 
 
 		 388 aa  151  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  29.29 
 
 		 407 aa  151  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.86 
 
 		 403 aa  147  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  27.7 
 
 		 400 aa  145  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28.39 
 
 		 381 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  28.42 
 
 		 386 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  26.33 
 
 		 385 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  26.58 
 
 		 385 aa  138  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  28.5 
 
 		 387 aa  137  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.18 
 
 		 389 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  26.46 
 
 		 384 aa  132  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.62 
 
 		 376 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  27.62 
 
 		 376 aa  131  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  26.93 
 
 		 429 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.65 
 
 		 390 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  27.11 
 
 		 376 aa  128  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  25.95 
 
 		 382 aa  127  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  27.11 
 
 		 376 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  27.11 
 
 		 376 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  27.11 
 
 		 376 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  25.77 
 
 		 376 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  26.85 
 
 		 376 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  27.37 
 
 		 376 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  26.85 
 
 		 376 aa  126  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  28.24 
 
 		 582 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  26.22 
 
 		 373 aa  125  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  25.5 
 
 		 392 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  24.44 
 
 		 443 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  34.81 
 
 		 234 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  24.19 
 
 		 401 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.88 
 
 		 430 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.67 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  25.45 
 
 		 448 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.05 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.25 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.26 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  22.51 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  23.82 
 
 		 467 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  25.22 
 
 		 378 aa  74.3  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  32.47 
 
 		 187 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.55 
 
 		 444 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  24.07 
 
 		 419 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  24.36 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  24.52 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.34 
 
 		 1067 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.3 
 
 		 438 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  23.38 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.33 
 
 		 422 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>