297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3129 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  100 
 
 
424 aa  827    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  70.69 
 
 
407 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  67.66 
 
 
412 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  69.69 
 
 
397 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  64.85 
 
 
403 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  67.42 
 
 
403 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  64.52 
 
 
402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  57.83 
 
 
402 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  55.04 
 
 
388 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  57.21 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  55.99 
 
 
390 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  47.51 
 
 
385 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  47.8 
 
 
387 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  45.5 
 
 
383 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  44.15 
 
 
384 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  44.15 
 
 
386 aa  338  9e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  46.34 
 
 
384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  44.7 
 
 
396 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  46.67 
 
 
389 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  45.38 
 
 
385 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  44.62 
 
 
384 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  42.47 
 
 
388 aa  315  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  40.87 
 
 
396 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  43.31 
 
 
386 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  44.19 
 
 
386 aa  309  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  40.3 
 
 
400 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  39.84 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  40.99 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  43.28 
 
 
381 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  42.11 
 
 
386 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  44.26 
 
 
382 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  41.6 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  41.32 
 
 
385 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  35.48 
 
 
392 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  39.95 
 
 
389 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  38.54 
 
 
376 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
373 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  37.2 
 
 
376 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  37.2 
 
 
376 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  37.2 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  37.2 
 
 
376 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  39.68 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.51 
 
 
460 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  34.86 
 
 
441 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  33.93 
 
 
429 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  36.55 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  35.62 
 
 
470 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  33.58 
 
 
461 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  33.94 
 
 
464 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  32.64 
 
 
525 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  35.7 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  35.92 
 
 
1498 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  29.97 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.1 
 
 
429 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  32.06 
 
 
401 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  32.27 
 
 
988 aa  166  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  31.3 
 
 
908 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  30.93 
 
 
1010 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.17 
 
 
1024 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  29.29 
 
 
1005 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  36.15 
 
 
444 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.85 
 
 
1029 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  29.89 
 
 
1020 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  28.91 
 
 
1024 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.02 
 
 
1046 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  29.65 
 
 
424 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  28.61 
 
 
763 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  28.68 
 
 
1010 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.65 
 
 
1024 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  28.36 
 
 
839 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  28.61 
 
 
1029 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.42 
 
 
1029 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  28.16 
 
 
1021 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  29.25 
 
 
1018 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  27.11 
 
 
1024 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  29.95 
 
 
424 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  27.49 
 
 
443 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  44.79 
 
 
560 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  31.62 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  25.7 
 
 
467 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  24.8 
 
 
435 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.53 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.08 
 
 
430 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.27 
 
 
439 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.91 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  23.82 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.54 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  28.88 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.37 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.62 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  29.79 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.51 
 
 
428 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  24.94 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.63 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  25.42 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>