116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5128 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  100 
 
 		 434 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  59.08 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  46.56 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  44.83 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  41.32 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  36.64 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  36.41 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  36.64 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  36.12 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  35.33 
 
 		 422 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  35.11 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  34.66 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  34 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  33.26 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  34.4 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  33.73 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  35.31 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  33.66 
 
 		 1498 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.18 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.29 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  31.68 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  30.18 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  27.76 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  28.18 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  29.14 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  26.03 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.68 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  27.56 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  26.37 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  25.98 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  27.18 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  27.74 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  26.4 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.97 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  27.17 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.59 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  25.77 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  26.12 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  26.12 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  26.96 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.56 
 
 		 403 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  24.62 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  25.73 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  26.46 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  25.27 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  25.54 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  25.12 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.94 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  27.21 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.17 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  26.58 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  26.04 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  24.57 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.41 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  23.26 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  24.19 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.36 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  23.99 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.38 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  25.42 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  24.37 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.33 
 
 		 1046 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  24.69 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  23.44 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  24.55 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  23.37 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  23.44 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  23.37 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.3 
 
 		 1020 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  23.37 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  23.37 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  23.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  23.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  23.44 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.14 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  24.24 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  23.1 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  25.66 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  22.54 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  22.8 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  22.75 
 
 		 1010 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  22.5 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  22.79 
 
 		 1018 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  22.35 
 
 		 1024 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  20.49 
 
 		 1010 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  22.39 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  23.94 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  23.4 
 
 		 1021 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  23.28 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  21.46 
 
 		 1005 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.27 
 
 		 908 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  20.55 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  21.55 
 
 		 1024 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  21.58 
 
 		 1024 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  22.85 
 
 		 460 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  29.84 
 
 		 1078 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  23.45 
 
 		 1029 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  19.15 
 
 		 988 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  21.58 
 
 		 1024 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>