127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3239 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  73.65 
 
 		 439 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  899    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  63.42 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  58.53 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  56.91 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  56.58 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  56.22 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  57.93 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  57.45 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  57.45 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  57.6 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  55.63 
 
 		 438 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  51.67 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  35.15 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  35.45 
 
 		 447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  35.36 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  33.49 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  34.52 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.19 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.58 
 
 		 1498 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  27.63 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  28.46 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  29.06 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  31.13 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  26.88 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  26.84 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  28.46 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  28.46 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  28.17 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  27.48 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.78 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.6 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  25.78 
 
 		 420 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.76 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  26.75 
 
 		 386 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  25.19 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  25.96 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  26.38 
 
 		 386 aa  103  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  25.82 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  24.62 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  23.62 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  25.81 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  25.44 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25.81 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.59 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  24.47 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  24.43 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.07 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  24.23 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.26 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.01 
 
 		 382 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  24.34 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  25 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  27.51 
 
 		 384 aa  91.3  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  26.56 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  25.61 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  26.18 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  22.51 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.8 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  23.26 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  24.26 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.93 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  22.67 
 
 		 1010 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  25.26 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  23.74 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  22.78 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.18 
 
 		 908 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.8 
 
 		 988 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  23.47 
 
 		 1005 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.37 
 
 		 1046 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  22.6 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.33 
 
 		 1020 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  21.21 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  22.27 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  22.2 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  22.69 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  21.09 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  22.41 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  22.46 
 
 		 1024 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  23.57 
 
 		 1029 aa  60.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  23.15 
 
 		 1029 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  24.09 
 
 		 1010 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  22.91 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  22.85 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  22.67 
 
 		 839 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  22.74 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  21.85 
 
 		 1024 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  22.22 
 
 		 1024 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  21.85 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  21.9 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  20.1 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  20.76 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  20.76 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  20.76 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  22.22 
 
 		 1024 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  21.85 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  21.52 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  30.87 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  21.57 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>