103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4175 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  100 
 
 		 436 aa  890    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  50.46 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  49.55 
 
 		 430 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  46.9 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  46.73 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  38.44 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  38.33 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  37.97 
 
 		 429 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  36.89 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  36.87 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  37.1 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  36.56 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  37.03 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  35.05 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  37.77 
 
 		 428 aa  252  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  33.26 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  35.36 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  35.29 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  31.38 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  29.24 
 
 		 1498 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29.31 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  27.98 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  29.71 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  28.68 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  29.23 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  28.24 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  29.52 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  26.87 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  27.32 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.85 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.37 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.98 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  27.96 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  26.18 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  28.82 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  25.67 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  25.67 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  26.79 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  27.15 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  27.61 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.75 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  26.1 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  27.3 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  24.47 
 
 		 385 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  24.27 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  25.88 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  26.67 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.7 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  26.23 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  24.88 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.26 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.41 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  25.42 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  24.93 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  25.86 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  25.38 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  22.76 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.74 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.3 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.79 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  25.8 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  25.48 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  25.8 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  25.8 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  25.22 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  25.48 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  25.48 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  25.65 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  25.48 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.6 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  25.07 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  25.16 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  26.13 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  23.94 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.1 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  25.47 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.51 
 
 		 908 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  22.81 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  23.65 
 
 		 1010 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  21.81 
 
 		 1005 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.46 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  22.2 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.19 
 
 		 1046 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  24.12 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.91 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  23.48 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  23.65 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  22.17 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  23.45 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  23.28 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  24.15 
 
 		 1010 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  23.28 
 
 		 839 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.19 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  23.33 
 
 		 1029 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  43.08 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  22.72 
 
 		 1029 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  23.59 
 
 		 1029 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  23.04 
 
 		 763 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  34.43 
 
 		 574 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>