More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03085 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  100 
 
 		 574 aa  1146    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  48.85 
 
 		 613 aa  548  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  49.55 
 
 		 608 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  42.93 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  42.03 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  40.76 
 
 		 565 aa  359  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  38.05 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  40.18 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  37.85 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  37.95 
 
 		 569 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  37.1 
 
 		 576 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  37.64 
 
 		 564 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 569 aa  293  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  39.08 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  36.67 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  33.03 
 
 		 596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  35.18 
 
 		 569 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  36.61 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.82 
 
 		 574 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  35.27 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 575 aa  243  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  34.69 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  36.12 
 
 		 535 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  31.53 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.78 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 620 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  34.16 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.85 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  33.28 
 
 		 576 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 580 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 530 aa  208  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  32.53 
 
 		 589 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  31.8 
 
 		 560 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.26 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  29.75 
 
 		 583 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 584 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  35 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 563 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 568 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  31.41 
 
 		 565 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  29.59 
 
 		 583 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.82 
 
 		 606 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  31.27 
 
 		 560 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  33.22 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 556 aa  193  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  31.11 
 
 		 580 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  30.85 
 
 		 580 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.17 
 
 		 564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.36 
 
 		 601 aa  191  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.24 
 
 		 560 aa  190  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  29.04 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.9 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  32.86 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.18 
 
 		 553 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.96 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.42 
 
 		 522 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.87 
 
 		 583 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.49 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.99 
 
 		 539 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 619 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 541 aa  177  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.59 
 
 		 579 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.53 
 
 		 545 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 558 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.32 
 
 		 547 aa  170  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 556 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 563 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 		 537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 544 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.7 
 
 		 542 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.95 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.52 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>