More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3630 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  100 
 
 
525 aa  1095    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  73.09 
 
 
464 aa  729    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  75.28 
 
 
460 aa  737    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  57.29 
 
 
469 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  57.04 
 
 
475 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  54.26 
 
 
471 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  56.38 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  40.68 
 
 
560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  42.04 
 
 
441 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.47 
 
 
461 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  35.87 
 
 
1005 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  34.83 
 
 
988 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  37.53 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  37.05 
 
 
1018 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  36.76 
 
 
763 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  36.76 
 
 
839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  36.52 
 
 
1029 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  37.35 
 
 
908 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  34.34 
 
 
1024 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  36.08 
 
 
1029 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  34.34 
 
 
1024 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  34.11 
 
 
1024 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  34.69 
 
 
1024 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  36.03 
 
 
1029 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  36.9 
 
 
386 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  36.32 
 
 
386 aa  234  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  36.43 
 
 
384 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  34.75 
 
 
384 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  34.88 
 
 
1021 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  34.58 
 
 
1010 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  35.54 
 
 
1010 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  34.53 
 
 
1046 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  33.93 
 
 
1020 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  32.86 
 
 
1498 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  34.9 
 
 
407 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  34.46 
 
 
424 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  34.43 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  34.56 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  35.26 
 
 
387 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  34 
 
 
396 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  33.91 
 
 
400 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  33.58 
 
 
388 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  33.42 
 
 
403 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  32.2 
 
 
397 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  34.76 
 
 
385 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  34.09 
 
 
389 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  32.99 
 
 
402 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.83 
 
 
412 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  32.91 
 
 
383 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  32.68 
 
 
396 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.17 
 
 
403 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  34.78 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  31.63 
 
 
429 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  33.42 
 
 
386 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  31.16 
 
 
388 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32 
 
 
402 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  32.9 
 
 
424 aa  189  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  31.65 
 
 
384 aa  187  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  31.5 
 
 
420 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  31.59 
 
 
385 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  31.09 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.9 
 
 
390 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  29.75 
 
 
382 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.18 
 
 
392 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  28.8 
 
 
376 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  28.13 
 
 
376 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  28.13 
 
 
376 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  27.88 
 
 
376 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  27.62 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  29.11 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  27.88 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  27.88 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  27.88 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.88 
 
 
376 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  27.88 
 
 
376 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  26.85 
 
 
376 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  28.01 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  27.83 
 
 
429 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  26.8 
 
 
378 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.07 
 
 
401 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.28 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.62 
 
 
430 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  23.18 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  23.43 
 
 
421 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  23.95 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  23.72 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.39 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.56 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03850  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  24.48 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  21.84 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  22.96 
 
 
439 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  53.23 
 
 
382 aa  64.3  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  31.78 
 
 
573 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  32.81 
 
 
429 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  21.88 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  32.03 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  46.58 
 
 
1084 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  22.88 
 
 
438 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>