More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5700 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  81.56 
 
 		 425 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  88.29 
 
 		 427 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  100 
 
 		 424 aa  856    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  62.44 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  61.96 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  35.49 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  34.29 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  31.64 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  30.53 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  31.58 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  28.06 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.84 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  31.73 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  30.28 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  26.93 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  27.93 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  30.58 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.64 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  26.43 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  29.1 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  31.14 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  30.38 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  29.58 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  29.83 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  28.43 
 
 		 370 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  29.83 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  29.83 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  31.49 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  29.83 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  29.05 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  33.09 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  29.48 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  27.63 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  28.26 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  28.99 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  26.47 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  26.47 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  26.47 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  26.08 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  26.47 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  26.47 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  26.2 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  25.4 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  26.2 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  26.2 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  24.42 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.79 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  49.25 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.64 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  25.86 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  40.62 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  23.76 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  36.17 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  51.52 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  26.28 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  48.57 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  46.88 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.55 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  47.54 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  44.62 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  40.62 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  50 
 
 		 442 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  48.39 
 
 		 561 aa  57  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  41.79 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  38.89 
 
 		 588 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 584 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.78 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  26.87 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.39 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  38.89 
 
 		 588 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  38.89 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  38.89 
 
 		 699 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  38.89 
 
 		 584 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  38.89 
 
 		 584 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  38.89 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  42 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.33 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  42.42 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.43 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  45.45 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  30.77 
 
 		 587 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.08 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0286  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.82 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  39.13 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.08 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  23.62 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  45.45 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.06 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>