More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4546 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  90.24 
 
 		 420 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  100 
 
 		 420 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  63.64 
 
 		 425 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  62.44 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  61.52 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  33 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  31.35 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  29.63 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  31.55 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.27 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  26.87 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.47 
 
 		 412 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  26.75 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  27.12 
 
 		 403 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  26.38 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  28.16 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  30.54 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  29.66 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  30.48 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  29.76 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  27.76 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  27.69 
 
 		 370 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  29.16 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  27.94 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  25.8 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  27.7 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  29.21 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.47 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  28.25 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  26.14 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  25.37 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  27.84 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  25.89 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  27.43 
 
 		 379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  25.63 
 
 		 366 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.81 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  48.48 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.1 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.94 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.56 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.56 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.6 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  23.23 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  47.19 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  46.03 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.44 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  47.62 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  46.88 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.94 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  24.06 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  32.68 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.03 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  41.54 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  36.84 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.55 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  44.62 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.62 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.1 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.12 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  40 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  40 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  42.62 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  44.62 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  31.43 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  32.65 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  36.26 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.08 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  45.45 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  41.75 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  37.5 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  39.77 
 
 		 564 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  43.94 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>