More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0046 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  100 
 
 		 481 aa  996    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  77.57 
 
 		 486 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  69.94 
 
 		 480 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  68.05 
 
 		 483 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  67.22 
 
 		 485 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  65.62 
 
 		 496 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  67.57 
 
 		 479 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  67.84 
 
 		 485 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  66.53 
 
 		 499 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  66.39 
 
 		 479 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  69.7 
 
 		 473 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  67.84 
 
 		 483 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  67.43 
 
 		 485 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  68.04 
 
 		 485 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  67.43 
 
 		 485 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  66.95 
 
 		 479 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  68.25 
 
 		 485 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  66.04 
 
 		 479 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  67.36 
 
 		 483 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  68.04 
 
 		 485 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  77.13 
 
 		 486 aa  751    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  77.55 
 
 		 481 aa  786    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  75.57 
 
 		 483 aa  729    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  61.91 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  63.25 
 
 		 475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  57.53 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  56.39 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  56.39 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  54.28 
 
 		 489 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 484 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  53.25 
 
 		 484 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  55.35 
 
 		 484 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  53.25 
 
 		 484 aa  538  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  52.62 
 
 		 484 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  53.25 
 
 		 484 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  53.46 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  54.79 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  54.17 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  51.35 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  46.44 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  44.66 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  46.47 
 
 		 467 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  42.36 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  42.83 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  42.11 
 
 		 460 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  44.61 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  39.91 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  43.1 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  40.94 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  40.94 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  40.94 
 
 		 475 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.12 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.69 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  38.83 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  42.16 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  38.03 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.69 
 
 		 472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.7 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  38.15 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  38.15 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  38.15 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  38.15 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  38.15 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  38.15 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  38.15 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  40.67 
 
 		 478 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  37.93 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  38.68 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  36.23 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  37.96 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  38.23 
 
 		 477 aa  290  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  37.96 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  37.14 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  38.1 
 
 		 451 aa  283  7.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.73 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  40.6 
 
 		 467 aa  280  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  37.5 
 
 		 471 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  35.38 
 
 		 484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.05 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  35.95 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 475 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  35.02 
 
 		 484 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  35.78 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  36.67 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  36.01 
 
 		 477 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  35.81 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  35.81 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  35.78 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  35.05 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  35.91 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  35.28 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  33.54 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  32.75 
 
 		 456 aa  253  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.61 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  30.99 
 
 		 451 aa  251  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  32.54 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>