More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2864 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  68.41 
 
 		 480 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  65.42 
 
 		 479 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  65.42 
 
 		 479 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  67.36 
 
 		 485 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  66.94 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  66.74 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  64.58 
 
 		 496 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  66.74 
 
 		 483 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  71 
 
 		 473 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  77.57 
 
 		 481 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  67.15 
 
 		 485 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  66.74 
 
 		 483 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  66.94 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  65.21 
 
 		 479 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  65.42 
 
 		 499 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  64.58 
 
 		 479 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  67.36 
 
 		 483 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  67.15 
 
 		 485 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  66.94 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  100 
 
 		 486 aa  1001    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  85.06 
 
 		 486 aa  839    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  78.75 
 
 		 481 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  81.97 
 
 		 483 aa  789    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  61.83 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  64.18 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  59.91 
 
 		 485 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  53.46 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  54.32 
 
 		 489 aa  535  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  54.12 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  53.29 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  54.08 
 
 		 484 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 484 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  51.04 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  51.57 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  51.25 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  53.95 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  51.67 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  53.95 
 
 		 501 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  52.59 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  51.66 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  51.36 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  44.66 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  43.63 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  45.38 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  41.92 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  42.32 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  41.21 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  40.57 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  39.37 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  39.37 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  39.37 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  43.41 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.17 
 
 		 469 aa  340  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  42.21 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.69 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.99 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  38.18 
 
 		 464 aa  315  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  37.72 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  37.72 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  37.72 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  41.77 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  43.1 
 
 		 479 aa  310  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.53 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  39.12 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  35.84 
 
 		 479 aa  302  9e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  40.29 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  35.96 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  36.6 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  36.82 
 
 		 461 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  33.91 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  36.52 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  39.57 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  37.66 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  37.04 
 
 		 471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  36.76 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  36.44 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  35.26 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  33.83 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  33.83 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.62 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  35.86 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  32.68 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  33.76 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  34.61 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  34.95 
 
 		 489 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  34.32 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  35.44 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  35.88 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  35.88 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  35.99 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  35.99 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  32.97 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  39.49 
 
 		 503 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  32.75 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  33.63 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>