More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1497 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  73.74 
 
 		 489 aa  750    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  83.06 
 
 		 484 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  82.44 
 
 		 484 aa  860    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  87.4 
 
 		 501 aa  900    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  80.58 
 
 		 484 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  66.04 
 
 		 485 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  83.68 
 
 		 484 aa  865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  66.6 
 
 		 487 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  85.33 
 
 		 483 aa  877    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  100 
 
 		 484 aa  1007    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  89.26 
 
 		 483 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  71.61 
 
 		 485 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  75.47 
 
 		 489 aa  767    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  73.74 
 
 		 489 aa  751    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  87.4 
 
 		 483 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  73.79 
 
 		 484 aa  755    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  55.07 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  54.3 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  54.45 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  54.7 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  54.64 
 
 		 485 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  54.64 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  53.65 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  53.81 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  53.93 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  53 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  54.02 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  54.02 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  53.44 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  53.81 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  53.24 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  53.22 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  52.4 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  52.61 
 
 		 479 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  53.22 
 
 		 478 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  53.28 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  56.51 
 
 		 475 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  53.25 
 
 		 481 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  54.08 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  51.55 
 
 		 486 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  50.21 
 
 		 483 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  50.11 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  48.69 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  46.81 
 
 		 460 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  43.89 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  44.81 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  44.84 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  42.79 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  42.39 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  41.94 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  41.94 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  41.94 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.76 
 
 		 469 aa  358  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  40.9 
 
 		 471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.73 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  42.3 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.77 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  40.17 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  40.68 
 
 		 478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  39.82 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  39.39 
 
 		 461 aa  332  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  39.39 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  39.39 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  40.26 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  38.63 
 
 		 477 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  41.23 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  39.43 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  39.96 
 
 		 474 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  40.54 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  38.86 
 
 		 467 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  39.19 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  38.65 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  38.29 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  38.01 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.43 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  36.84 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  37.5 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  37 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  37.42 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  37.21 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  35.5 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  35.61 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  35.61 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  37.39 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  35.73 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  36.63 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  35.73 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  33.77 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  33.99 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.99 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  39.19 
 
 		 467 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  35.89 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 477 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>