More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5170 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 469 aa  953    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  66.95 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  63.54 
 
 		 472 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  62.03 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  63.21 
 
 		 472 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  60.55 
 
 		 471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  60.34 
 
 		 478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  62.71 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  50.65 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  52.06 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  49.89 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  48.08 
 
 		 475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  48.08 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  48.08 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  44.35 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  49.57 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  43.72 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  38.94 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  42.89 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  42.95 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  44.03 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  44.13 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  41.99 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  41.56 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  43.17 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  43.71 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  42.76 
 
 		 484 aa  358  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  42.68 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  43.44 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  43.5 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  42.92 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  45.36 
 
 		 475 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  43.41 
 
 		 478 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  42.7 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  41.39 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  44.47 
 
 		 478 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  43.07 
 
 		 483 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  42.39 
 
 		 479 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  42.86 
 
 		 483 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  42.08 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  41.96 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  43.91 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  42.49 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  42.49 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  42.46 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  42.7 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  41.87 
 
 		 489 aa  349  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  42.7 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  42.83 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  40.69 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  41.74 
 
 		 496 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  41.3 
 
 		 480 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  40.56 
 
 		 489 aa  346  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  41.74 
 
 		 479 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  42.95 
 
 		 473 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  40.35 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  39.31 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  43.52 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  42.61 
 
 		 485 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  42.83 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  42.61 
 
 		 485 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  42.39 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  42.83 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  42.83 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  38.33 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  38.39 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  41.99 
 
 		 481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  41.74 
 
 		 479 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  40.73 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  41.51 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  41.3 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  43.68 
 
 		 486 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  41.42 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  41.42 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  41.47 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  41.47 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  40.65 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  41.47 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  41.47 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  41.47 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  41.72 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  41.25 
 
 		 461 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  38.95 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  42.37 
 
 		 483 aa  329  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  42.17 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  36.29 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  42.98 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  42.12 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  39.61 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  39.02 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  39.1 
 
 		 464 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  36.61 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  39.02 
 
 		 485 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  38.81 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  39.78 
 
 		 451 aa  306  7e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.26 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  42.05 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  34.2 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  37.39 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>