More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0244 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 451 aa  940    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  53.66 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  41.45 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  42.29 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  39.69 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  42.07 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  40.79 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  42.01 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  39.55 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  40.09 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  40.53 
 
 		 469 aa  320  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  39.44 
 
 		 475 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  39.44 
 
 		 475 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  38.85 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  39.44 
 
 		 475 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  40.35 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  39.78 
 
 		 471 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  40.39 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.61 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  40.27 
 
 		 472 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  38.73 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  38.77 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  38.77 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  39.31 
 
 		 472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  38.55 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  39.78 
 
 		 469 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  38.04 
 
 		 484 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  38.83 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  38.83 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  39.14 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  39.14 
 
 		 501 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  39.34 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  39.14 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  38.83 
 
 		 483 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  38.77 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  36.26 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  38.29 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  38.65 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  39.06 
 
 		 473 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  37.42 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  37.42 
 
 		 489 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  39.56 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  39.64 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  38.79 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  38.79 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  39.64 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  39.19 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  38.44 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  36.76 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  37.73 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  38.96 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  38.96 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  38.37 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  38.96 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  38.39 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  37.14 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  36.51 
 
 		 484 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  36.6 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  38.12 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  35.98 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  38.34 
 
 		 478 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  38.3 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  36.89 
 
 		 479 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  37.07 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  37.84 
 
 		 471 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  36.76 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  34.28 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  35.87 
 
 		 477 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  37.66 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  35.45 
 
 		 487 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  37.34 
 
 		 475 aa  279  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  37.69 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  36.34 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  41 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  37.47 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  38.97 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  41.04 
 
 		 483 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  39.86 
 
 		 486 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.25 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  35.43 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  39.73 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  37.66 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  37.72 
 
 		 475 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  34.54 
 
 		 477 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  35.43 
 
 		 464 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  38.79 
 
 		 467 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  34.75 
 
 		 485 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  34.75 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  34.53 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  32.6 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 		 489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>