More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2664 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  73.61 
 
 
489 aa  749    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  73.49 
 
 
484 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  70.92 
 
 
501 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  73.25 
 
 
484 aa  755    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  63.86 
 
 
485 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  70.43 
 
 
487 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  71.19 
 
 
484 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  72.18 
 
 
483 aa  722    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  71.55 
 
 
483 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  71.61 
 
 
484 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  73.61 
 
 
489 aa  749    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  72.86 
 
 
484 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  100 
 
 
485 aa  1004    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  72.65 
 
 
484 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  72.84 
 
 
489 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  70.92 
 
 
483 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  52.71 
 
 
480 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  53.01 
 
 
479 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  53.22 
 
 
479 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  53.01 
 
 
479 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  53.4 
 
 
483 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  52.6 
 
 
499 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  53.61 
 
 
483 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  52.88 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  52.18 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  53.29 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  53.01 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  52.67 
 
 
485 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  53.29 
 
 
485 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  51.77 
 
 
479 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  52.99 
 
 
485 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  52.88 
 
 
485 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  52.16 
 
 
483 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  52.88 
 
 
485 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  54.17 
 
 
481 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  51.79 
 
 
473 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  54.25 
 
 
475 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  51.66 
 
 
486 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  50.43 
 
 
478 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  51.55 
 
 
486 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  51.45 
 
 
483 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  45.57 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  45.77 
 
 
475 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  45.39 
 
 
460 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  43.56 
 
 
467 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  44.3 
 
 
459 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  42.54 
 
 
459 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  42.7 
 
 
463 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  40.56 
 
 
471 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.86 
 
 
472 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  41.96 
 
 
469 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  40.17 
 
 
469 aa  338  9e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  40.55 
 
 
478 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  41.35 
 
 
479 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  38.96 
 
 
461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  38.96 
 
 
461 aa  329  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  38.96 
 
 
461 aa  329  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  38.96 
 
 
461 aa  329  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  38.96 
 
 
461 aa  329  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  38.96 
 
 
465 aa  329  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  38.96 
 
 
465 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  38.74 
 
 
461 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  38.31 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  38.31 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  38.31 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  39.87 
 
 
464 aa  326  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  39.74 
 
 
472 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.06 
 
 
473 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  38.39 
 
 
479 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  41.32 
 
 
454 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  40.61 
 
 
461 aa  316  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  38.58 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  38.51 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  37.8 
 
 
457 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  37.23 
 
 
471 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  37.23 
 
 
471 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  38.86 
 
 
477 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  37.74 
 
 
472 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  37.45 
 
 
473 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  36.98 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  36.66 
 
 
475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  37.81 
 
 
466 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  36.25 
 
 
484 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  36.04 
 
 
484 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  37.99 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  36.76 
 
 
451 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  36.03 
 
 
475 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  36.09 
 
 
478 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  36.82 
 
 
489 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  36.95 
 
 
503 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  39.53 
 
 
467 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  34.64 
 
 
457 aa  274  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.55 
 
 
474 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  35.22 
 
 
456 aa  274  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  36.5 
 
 
464 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
489 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  33.99 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  32.78 
 
 
485 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  33.48 
 
 
485 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.26 
 
 
485 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>