More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0278 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  100 
 
 
489 aa  1019    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  73.47 
 
 
501 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  72.84 
 
 
483 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  95.24 
 
 
484 aa  970    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  69.14 
 
 
487 aa  699    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  73.74 
 
 
484 aa  750    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  73.74 
 
 
484 aa  757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  73.61 
 
 
485 aa  749    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  72.9 
 
 
484 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  99.8 
 
 
489 aa  1017    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  73.53 
 
 
484 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  71.37 
 
 
489 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  73.68 
 
 
483 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  65.77 
 
 
485 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  73.26 
 
 
483 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  74.16 
 
 
484 aa  756    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  56.78 
 
 
481 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  55.04 
 
 
480 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  55.23 
 
 
479 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  54.15 
 
 
483 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  54.36 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  53.11 
 
 
496 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  53.14 
 
 
479 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  53.94 
 
 
483 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  53.64 
 
 
485 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  56.39 
 
 
481 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  53.64 
 
 
485 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  53.6 
 
 
473 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  52.28 
 
 
499 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  53.64 
 
 
485 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  52.72 
 
 
479 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  52.93 
 
 
479 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  52.71 
 
 
485 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  53.43 
 
 
485 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  52.81 
 
 
485 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  52.81 
 
 
485 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  53 
 
 
478 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  54.45 
 
 
486 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  54.12 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  56.51 
 
 
475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  53.77 
 
 
483 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  46.85 
 
 
472 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  48.34 
 
 
467 aa  428  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  46.27 
 
 
475 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  47.58 
 
 
460 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  44.49 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  43.83 
 
 
459 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  44.32 
 
 
463 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  41.54 
 
 
469 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  40.48 
 
 
471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  39.57 
 
 
472 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  41.06 
 
 
478 aa  346  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  40.35 
 
 
469 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  41.29 
 
 
464 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  40.39 
 
 
474 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  40.79 
 
 
473 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  38.95 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  38.95 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  40.7 
 
 
461 aa  339  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  38.95 
 
 
475 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  40.7 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  40.7 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  40.7 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  40.7 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  40.7 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  40.7 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  40.48 
 
 
461 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.91 
 
 
472 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  40.26 
 
 
479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  40.64 
 
 
479 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  40.81 
 
 
466 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  40.66 
 
 
479 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  39.3 
 
 
477 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  39.31 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  39.61 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  39.82 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  39.56 
 
 
454 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  39.09 
 
 
478 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  38.27 
 
 
457 aa  309  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  37.63 
 
 
471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  37.63 
 
 
471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  37.29 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  37.69 
 
 
475 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  37.17 
 
 
473 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  37.22 
 
 
464 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  37.42 
 
 
451 aa  297  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  36.67 
 
 
484 aa  296  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  37.47 
 
 
472 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  36.84 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  38.92 
 
 
467 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  39.07 
 
 
503 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  35.41 
 
 
477 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.05 
 
 
474 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  35.29 
 
 
485 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  35.51 
 
 
485 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  35.29 
 
 
485 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  36.27 
 
 
489 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  35.15 
 
 
457 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  35.95 
 
 
456 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  33.77 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>