More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0183 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  72.9 
 
 		 484 aa  748    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  73.47 
 
 		 489 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  80.79 
 
 		 484 aa  843    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  73.47 
 
 		 489 aa  745    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  84.89 
 
 		 483 aa  874    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  80.79 
 
 		 484 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  100 
 
 		 501 aa  1038    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  82.23 
 
 		 484 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  67.71 
 
 		 485 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  65.36 
 
 		 487 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  81.82 
 
 		 484 aa  852    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  87.4 
 
 		 484 aa  900    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  70.92 
 
 		 485 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  75 
 
 		 489 aa  772    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  94.82 
 
 		 483 aa  961    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  99.79 
 
 		 483 aa  1001    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  55.65 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  56.78 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  54.45 
 
 		 483 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  55.07 
 
 		 483 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  54.87 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  54.18 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  55.11 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  54.7 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  55.05 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  54.91 
 
 		 479 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  55.05 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  53.86 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  54.55 
 
 		 481 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  54.55 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  54.23 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  54.64 
 
 		 485 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  54.64 
 
 		 485 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  54.43 
 
 		 485 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  54.94 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  53.91 
 
 		 473 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  53.95 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  53.42 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  55.63 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  51.46 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  49.67 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  48.14 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  46.37 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  44.2 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  45.75 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  42.45 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  44.61 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  44.13 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  42.8 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  42.18 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  41.96 
 
 		 469 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  42.01 
 
 		 464 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  42.58 
 
 		 478 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  40.65 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  40.65 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  40.65 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  41.76 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  41.81 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  41.44 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  39.57 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  39.52 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  39.52 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  39.57 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  40.92 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  39.57 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  39.57 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  39.57 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  39.35 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  39.02 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  41.48 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  40.69 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  42.15 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  40.43 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  39.91 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  40.13 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  40.82 
 
 		 475 aa  316  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  37.86 
 
 		 479 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  40.87 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  39.83 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  39.14 
 
 		 451 aa  303  6.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  39.18 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  38.91 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  39.05 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  39.05 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.77 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  38.28 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  39.61 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  36.6 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  35.73 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.63 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  41.11 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  38.81 
 
 		 503 aa  279  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  34.47 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  34.57 
 
 		 456 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  36.13 
 
 		 485 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  35.76 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  35.97 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  37.06 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>