More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3107 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  99.59 
 
 		 485 aa  981    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  98.56 
 
 		 485 aa  972    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 485 aa  984    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  45.96 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  46.61 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  49.57 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  48.36 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  48.15 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  47.07 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  47.51 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  46.85 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  47.51 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  46.54 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  47.38 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  46.2 
 
 		 475 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  46.1 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  46.22 
 
 		 478 aa  412  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  44.19 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  43.78 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  43.2 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  47.05 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  42.17 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  43.76 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  40.83 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  39.31 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  38.46 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  38.96 
 
 		 463 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  39.02 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  35.75 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  36.29 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  36.29 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  36.29 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  36.3 
 
 		 484 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  38.16 
 
 		 465 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  38.16 
 
 		 465 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  36.23 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  38 
 
 		 461 aa  293  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  38 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  38 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  38 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  38 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  38 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  35.51 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  34.78 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  35.18 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  35.08 
 
 		 484 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  38.38 
 
 		 472 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  37.08 
 
 		 473 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  35.51 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  36.01 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  36.11 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  35.51 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  35.51 
 
 		 484 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  36.34 
 
 		 483 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  34.71 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  34.85 
 
 		 483 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  34.19 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  36.13 
 
 		 501 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  36.7 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  33.99 
 
 		 484 aa  273  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  36.33 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  35.04 
 
 		 472 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  34.42 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  34.49 
 
 		 481 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  32.31 
 
 		 479 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  37.04 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  34.06 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  35.44 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  33.76 
 
 		 474 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  35.05 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  34.06 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  34.49 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  34.27 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  33.04 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  36.7 
 
 		 475 aa  263  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  35.13 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  33.48 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  33.41 
 
 		 496 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  34.27 
 
 		 485 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  34.19 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  33.83 
 
 		 486 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  32.97 
 
 		 473 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 485 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  35.42 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  34.27 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  34.27 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  32.16 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  33.63 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  35.79 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  34.75 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  36.21 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  34.77 
 
 		 483 aa  242  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>