More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2108 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 489 aa  999    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  50.64 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  50.43 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  45.96 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  45.76 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  45.96 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  50 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  49.02 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  49.46 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  48.8 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  47.71 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  48.8 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  45.85 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  48.58 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  47.98 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  46.62 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  47.95 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  48.16 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  53.52 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  46.79 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  47.53 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  46.6 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  45.89 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  42.7 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  40.52 
 
 		 464 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  41.77 
 
 		 472 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  42.19 
 
 		 489 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  40.65 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  40.09 
 
 		 475 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  40.09 
 
 		 475 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  40.77 
 
 		 469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  40.09 
 
 		 475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  40.73 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  40.55 
 
 		 527 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  40.52 
 
 		 460 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  40.52 
 
 		 463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  37.8 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  38.33 
 
 		 472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  37.74 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  37.04 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  38.17 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  37 
 
 		 478 aa  289  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  36.96 
 
 		 454 aa  289  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  35.98 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  36.84 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  36.85 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  36.54 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  33.7 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  36.54 
 
 		 484 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 489 aa  279  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  36.68 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  37.06 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  36.82 
 
 		 485 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  38.82 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  37.06 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  37.17 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  34.98 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  34.98 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  34.92 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  34.92 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  37.06 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  35.75 
 
 		 484 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  34.92 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  34.92 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  34.92 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  35.14 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  36.98 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  36.3 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  34.92 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  35.84 
 
 		 496 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  36.27 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  36.23 
 
 		 479 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  35.89 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  35.57 
 
 		 479 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  36.09 
 
 		 499 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.19 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  36.93 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  35.08 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  35.87 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  36.67 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  36.67 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  36.67 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  36.72 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  35.18 
 
 		 474 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  36.52 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  36.46 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  36.46 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  35.45 
 
 		 487 aa  259  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  33.12 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  36.46 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  35.65 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  33.41 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  36.46 
 
 		 485 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  35.08 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  36.66 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  36.9 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  35.68 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  34.95 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  35.05 
 
 		 481 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>