More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01380 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  100 
 
 
471 aa  980    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  42.24 
 
 
475 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  43.26 
 
 
489 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  40.37 
 
 
478 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  41.74 
 
 
479 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  41.57 
 
 
477 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  39.91 
 
 
527 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  41.04 
 
 
471 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  41.04 
 
 
471 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  39.63 
 
 
467 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  40.23 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  40 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  39.69 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  40.19 
 
 
466 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  37.76 
 
 
484 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  40.48 
 
 
475 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  36.9 
 
 
484 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  40.43 
 
 
474 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  37.35 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  36.9 
 
 
489 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  35.9 
 
 
485 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  35.9 
 
 
485 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  35.9 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  36.89 
 
 
503 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  37.41 
 
 
472 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  36.45 
 
 
467 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  33.18 
 
 
464 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  33.73 
 
 
469 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  33.97 
 
 
463 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  33.33 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  33.11 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.8 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  32.49 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  32.88 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  32.89 
 
 
501 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  32.48 
 
 
475 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  33.41 
 
 
483 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  32.33 
 
 
489 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  32.33 
 
 
489 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  33.41 
 
 
483 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  32.42 
 
 
484 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  31.81 
 
 
489 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.38 
 
 
469 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  34.19 
 
 
478 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  32.42 
 
 
483 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  31.38 
 
 
485 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  31.63 
 
 
484 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  30.95 
 
 
475 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  30.95 
 
 
475 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  30.95 
 
 
475 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  30.11 
 
 
464 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  31.65 
 
 
487 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  33.49 
 
 
472 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  32.32 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  30.3 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  32.08 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  31.87 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  32.08 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  31.87 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  32.08 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  32.08 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  31.85 
 
 
461 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  30.25 
 
 
461 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  32.46 
 
 
472 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  31.32 
 
 
478 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  30.05 
 
 
481 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  32.06 
 
 
475 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  30.07 
 
 
473 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  32.73 
 
 
471 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  30.49 
 
 
479 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  33.07 
 
 
479 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.28 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  30.61 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  29.91 
 
 
473 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  31.6 
 
 
485 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  30.61 
 
 
485 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  30.61 
 
 
485 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  30.84 
 
 
479 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  31.19 
 
 
459 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  31.54 
 
 
496 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  31.07 
 
 
479 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  30.16 
 
 
485 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  30.11 
 
 
457 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  29.93 
 
 
485 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  31.29 
 
 
499 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  29.93 
 
 
485 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  29.41 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  30.98 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  29.62 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  31.21 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  29.09 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  29.66 
 
 
483 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  29.36 
 
 
459 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  29.61 
 
 
480 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  29.66 
 
 
483 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  30.02 
 
 
481 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  30.75 
 
 
456 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  30.09 
 
 
486 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  30.63 
 
 
474 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>