More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1684 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  100 
 
 
464 aa  944    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  54.41 
 
 
479 aa  499  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  48.03 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  48.03 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  48.03 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  48.03 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  48.03 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  48.03 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  48.03 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  48.03 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  48.28 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  51.02 
 
 
456 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  48.25 
 
 
457 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  46.22 
 
 
475 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  43.35 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  44.28 
 
 
484 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  44.1 
 
 
467 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  43.84 
 
 
484 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  43.04 
 
 
460 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  42.27 
 
 
477 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  43.1 
 
 
475 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  43.1 
 
 
475 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  43.1 
 
 
475 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  42.95 
 
 
467 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  43.01 
 
 
469 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  41.9 
 
 
474 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  42.95 
 
 
471 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  42.48 
 
 
479 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  42.3 
 
 
475 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  38.94 
 
 
469 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  42.27 
 
 
478 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  42.76 
 
 
472 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  46.53 
 
 
457 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  41.13 
 
 
466 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  42.24 
 
 
473 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  40.43 
 
 
472 aa  359  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  40.51 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  40.52 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  41.59 
 
 
473 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  38.61 
 
 
472 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  40.22 
 
 
479 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  40.87 
 
 
480 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  39.91 
 
 
461 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  42.01 
 
 
478 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  42.01 
 
 
501 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  42.01 
 
 
483 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  39.57 
 
 
479 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  44.44 
 
 
479 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  41.45 
 
 
451 aa  348  1e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  39.78 
 
 
496 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  40.86 
 
 
471 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  40.86 
 
 
471 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  41.2 
 
 
483 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  41.2 
 
 
483 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  41.36 
 
 
483 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  41.29 
 
 
489 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  38.33 
 
 
454 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  42.3 
 
 
484 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  41.29 
 
 
489 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  39.13 
 
 
479 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  41.36 
 
 
489 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  42.01 
 
 
483 aa  342  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  40.73 
 
 
475 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  39 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  40.83 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  38.26 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  41.05 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  40.39 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  37.83 
 
 
499 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  39.53 
 
 
483 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  40.09 
 
 
485 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  40.09 
 
 
485 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  40.09 
 
 
485 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  40.3 
 
 
485 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  39.87 
 
 
485 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  39.44 
 
 
485 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  39.44 
 
 
485 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  39.96 
 
 
459 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  40.61 
 
 
484 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  39.52 
 
 
484 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  39.78 
 
 
484 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  39.87 
 
 
485 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  42.64 
 
 
451 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  38.26 
 
 
481 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 
485 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  37.5 
 
 
485 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  37.72 
 
 
485 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  40.48 
 
 
475 aa  322  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  38.26 
 
 
473 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  39.45 
 
 
474 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 
489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  37.61 
 
 
478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  38.06 
 
 
474 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  38.61 
 
 
481 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  39.09 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  39.96 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  37.25 
 
 
464 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  37.74 
 
 
486 aa  299  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  37.63 
 
 
503 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  35.97 
 
 
467 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>