More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5687 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 477 aa  977    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  56.37 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  55.31 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  55.17 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  55.08 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  55.17 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  54.49 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  54.94 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  53.98 
 
 		 472 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  52.52 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  53.59 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  50.54 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  49.56 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  45.85 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  47.51 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  47.06 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  48.7 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  42.98 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  43.2 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  43.2 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  45.25 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  40.69 
 
 		 464 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  41.19 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  41.54 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  39 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  39.61 
 
 		 472 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  40.17 
 
 		 475 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  39.61 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  39.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  39.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  39.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  39.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  39.78 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  39.78 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  39.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  39.78 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  37.34 
 
 		 460 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  37.87 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  37.87 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  37.87 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  37.28 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  37.99 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  37.69 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.68 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  36.26 
 
 		 461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  35.41 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  35.41 
 
 		 489 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  34.75 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  34.26 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  35.08 
 
 		 484 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  36.58 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  37.25 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  34.68 
 
 		 483 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  34.68 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  34.47 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  35.32 
 
 		 489 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  35.06 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  35.7 
 
 		 471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  38.46 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  35.56 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  33.62 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  37.53 
 
 		 472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  35.91 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  35.37 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  35.89 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  36.7 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  34.47 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  34.44 
 
 		 496 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  33.69 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  35.37 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  36.74 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  33.19 
 
 		 457 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  35.15 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  35.37 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  37.35 
 
 		 471 aa  263  6.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  33.99 
 
 		 485 aa  263  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  36.76 
 
 		 486 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  32.76 
 
 		 487 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  33.48 
 
 		 474 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  33.04 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  34.98 
 
 		 473 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  36.52 
 
 		 457 aa  256  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  33.91 
 
 		 483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  34.54 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  33.7 
 
 		 483 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  34.82 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  35.73 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  35.95 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  31.51 
 
 		 459 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  32.33 
 
 		 474 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  37.59 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  36.17 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  33.84 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  33.19 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  33.19 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  33.26 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  33.19 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>