More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1488 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  100 
 
 
460 aa  939    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  53.52 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  43.96 
 
 
467 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  43.76 
 
 
485 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  46.29 
 
 
472 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  43.98 
 
 
485 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  43.76 
 
 
485 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  41.54 
 
 
477 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  45.53 
 
 
473 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  45.08 
 
 
471 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  45.08 
 
 
471 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  44.62 
 
 
471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  42.48 
 
 
477 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  43.34 
 
 
479 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  42.7 
 
 
466 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  43.01 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  44.03 
 
 
475 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  42.39 
 
 
484 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  39.61 
 
 
474 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  42.64 
 
 
478 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  42.39 
 
 
484 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  43.83 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  39.91 
 
 
464 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  37.91 
 
 
475 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  36.03 
 
 
472 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  35.93 
 
 
464 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  37.39 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  35.65 
 
 
467 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  37.07 
 
 
475 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  34.99 
 
 
461 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  34.99 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  34.5 
 
 
460 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  34.99 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  34.99 
 
 
461 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  37.07 
 
 
475 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  34.99 
 
 
461 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  37.07 
 
 
475 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  34.99 
 
 
461 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  34.99 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  36.36 
 
 
469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  34.99 
 
 
461 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 
527 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  38.14 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  36.19 
 
 
471 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  35.5 
 
 
489 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  34.49 
 
 
463 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  37.05 
 
 
473 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  34.35 
 
 
484 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  34.57 
 
 
484 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  33.84 
 
 
484 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  33.91 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  33.84 
 
 
489 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  33.84 
 
 
489 aa  246  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  34.94 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  33.98 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  35.47 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  32.83 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  34.13 
 
 
483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  31.22 
 
 
457 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  34.06 
 
 
483 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  33.41 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  36.45 
 
 
451 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  33.91 
 
 
483 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  33.91 
 
 
501 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  32.75 
 
 
459 aa  239  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  32.75 
 
 
456 aa  236  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  34.42 
 
 
485 aa  236  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  31.67 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  34 
 
 
461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  31.75 
 
 
474 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  32.97 
 
 
484 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  34.53 
 
 
467 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  32.63 
 
 
474 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  33.12 
 
 
496 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  34.39 
 
 
472 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  33.62 
 
 
485 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  34.87 
 
 
478 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  32.68 
 
 
479 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  31.68 
 
 
451 aa  226  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  32.68 
 
 
479 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  31.74 
 
 
479 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  31.89 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  33.12 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  32.9 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  36.74 
 
 
475 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  33.4 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  32.25 
 
 
473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  32.55 
 
 
483 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  31.32 
 
 
481 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  33.56 
 
 
479 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  31.45 
 
 
487 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  32.33 
 
 
483 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  31.48 
 
 
483 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  33.84 
 
 
478 aa  206  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  35.83 
 
 
479 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  33.19 
 
 
486 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  31.05 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  32.42 
 
 
485 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.25 
 
 
444 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  32.41 
 
 
486 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>