More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3269 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  100 
 
 
470 aa  953    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  50.64 
 
 
460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  33.83 
 
 
484 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  33.4 
 
 
484 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  34.78 
 
 
454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  32.48 
 
 
484 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  32.62 
 
 
483 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  32.62 
 
 
501 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  32.4 
 
 
484 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  31.99 
 
 
489 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  32.4 
 
 
483 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  32.76 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.31 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  32.18 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  32.18 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  32.53 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  32.18 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  32.18 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  32.47 
 
 
483 aa  220  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 
457 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.31 
 
 
453 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.09 
 
 
453 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.09 
 
 
453 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.83 
 
 
494 aa  216  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  31.28 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  30.33 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  30.47 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  30.47 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  30.26 
 
 
484 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  31.65 
 
 
475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  33.4 
 
 
460 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.65 
 
 
475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.65 
 
 
475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.87 
 
 
460 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  32.84 
 
 
463 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  30.26 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  30 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  33.72 
 
 
469 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.85 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  31.2 
 
 
472 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  30.36 
 
 
478 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  28.94 
 
 
483 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.6 
 
 
475 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  32.08 
 
 
474 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  31.6 
 
 
471 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  32.51 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  29.36 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  29.36 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  30.84 
 
 
461 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  30.67 
 
 
457 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  27.11 
 
 
457 aa  189  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  29.91 
 
 
487 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  29.44 
 
 
473 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  29.15 
 
 
496 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  29.79 
 
 
479 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  28.51 
 
 
483 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  28.51 
 
 
483 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  27.57 
 
 
464 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  32.09 
 
 
472 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  29.57 
 
 
499 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  29.54 
 
 
451 aa  187  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  31.56 
 
 
472 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  30.19 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  31.13 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  30.06 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  28.78 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  25.58 
 
 
474 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.27 
 
 
444 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.92 
 
 
464 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  30.11 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  30.08 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  29.83 
 
 
486 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  31.75 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  31.75 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  29.98 
 
 
446 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  27.96 
 
 
485 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  27.87 
 
 
485 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  27.87 
 
 
485 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  27.52 
 
 
485 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  30.93 
 
 
475 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  30.1 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  27.74 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  30.23 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  31.14 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  30.43 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  30.39 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.01 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  27.06 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  29.36 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  27.52 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  27.52 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  29.02 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  29.98 
 
 
475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.75 
 
 
449 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  26.77 
 
 
479 aa  173  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.58 
 
 
471 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  30.3 
 
 
478 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>