More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5168 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  88.22 
 
 		 494 aa  826    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 457 aa  921    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  36.5 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  35.35 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  35.35 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.57 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.57 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.57 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  35.57 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  35.12 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  38.37 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.73 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  37.02 
 
 		 444 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  34.9 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  34.9 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  34.9 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  34.9 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  37.02 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  35.89 
 
 		 444 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.16 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.59 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  36.88 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.15 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  36.77 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.07 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  36.2 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  37.44 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  36.49 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  34.37 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.44 
 
 		 440 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  35.29 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.12 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.06 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.68 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  35.07 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  34.31 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.16 
 
 		 425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.38 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  36.38 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  34.68 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.44 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  34.57 
 
 		 454 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  33.26 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  34.54 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  34.54 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.9 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  34.92 
 
 		 445 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  33.05 
 
 		 466 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  36.83 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  35.98 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  35.14 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  35.14 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  35.06 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  34.94 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.52 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  34.95 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  34.76 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  34.76 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  35.41 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  33.41 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  30.94 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  32.54 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.93 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  34.92 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  35.6 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.08 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.54 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  32.17 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  33.41 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.86 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  32.17 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  32.17 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  34.12 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  33.57 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.03 
 
 		 477 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  34.68 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  32.24 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  36.16 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  33.26 
 
 		 440 aa  213  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  34.54 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.11 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  33.48 
 
 		 475 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.88 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.26 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  31.34 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  34.24 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  31.53 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  35.1 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.4 
 
 		 427 aa  209  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  36.78 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  33.48 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.33 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  33.33 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.17 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  31.44 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.18 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>