More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0488 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  100 
 
 
442 aa  912    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  71.79 
 
 
439 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  72.15 
 
 
437 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  72.15 
 
 
437 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  67.57 
 
 
443 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  68.89 
 
 
439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  69.27 
 
 
440 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  63.62 
 
 
469 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  55.5 
 
 
443 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  55.5 
 
 
443 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.72 
 
 
442 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  43.21 
 
 
453 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  43.06 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  43.91 
 
 
440 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  42.79 
 
 
443 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  43.18 
 
 
441 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  42.47 
 
 
442 aa  346  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  41.4 
 
 
445 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  43.86 
 
 
456 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  44.22 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  44.22 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  40.5 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  41.63 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  41.75 
 
 
445 aa  339  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  44.77 
 
 
458 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  41.52 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  44.27 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  40.5 
 
 
444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  41.91 
 
 
453 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  41.18 
 
 
444 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  41.4 
 
 
445 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  42.22 
 
 
446 aa  332  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  40.5 
 
 
442 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  41.18 
 
 
446 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  40.27 
 
 
464 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  41.26 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  42.46 
 
 
444 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  41.7 
 
 
446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  40.72 
 
 
446 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  40.27 
 
 
444 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  39.14 
 
 
444 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  42.47 
 
 
445 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  39.23 
 
 
444 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  40.81 
 
 
446 aa  316  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  38.32 
 
 
444 aa  316  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  39.1 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  38.39 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  40.99 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  38.91 
 
 
442 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  40.04 
 
 
444 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  40.72 
 
 
453 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  38.63 
 
 
439 aa  295  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  37.98 
 
 
444 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  39.87 
 
 
445 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  40 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.78 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  38.98 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.27 
 
 
449 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  38.58 
 
 
449 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  38.39 
 
 
445 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  38.58 
 
 
449 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  38.79 
 
 
446 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  36.73 
 
 
439 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  38.73 
 
 
449 aa  263  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  39.15 
 
 
488 aa  256  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  35.73 
 
 
405 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  38.22 
 
 
423 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.4 
 
 
468 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  33.85 
 
 
455 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  35.78 
 
 
432 aa  236  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.71 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 
418 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.82 
 
 
399 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.03 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.9 
 
 
418 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.54 
 
 
457 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.48 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  30.99 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.09 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.89 
 
 
431 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  30.65 
 
 
425 aa  206  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  33.64 
 
 
430 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  32.33 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.66 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  32.33 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  34.79 
 
 
423 aa  200  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.92 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  30.98 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  30.98 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  30.98 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.09 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.78 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.95 
 
 
425 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  30.75 
 
 
428 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>