More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0292 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 442 aa  908    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  51.04 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  51.04 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  51.26 
 
 		 439 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  51.84 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  51.72 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  52.08 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  51.07 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  49.88 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  51.07 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  47.01 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  44.59 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  46.59 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  45.15 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  44.21 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  44.21 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  45.14 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  44.29 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  42.86 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  44.21 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  44.5 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  44.98 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  43.02 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  43.6 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  42 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  44.34 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  41.76 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  41.76 
 
 		 444 aa  342  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  43.18 
 
 		 453 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  44.05 
 
 		 446 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  43.55 
 
 		 446 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  41.36 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  42.72 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  43.27 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  41.78 
 
 		 448 aa  339  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  42.17 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  41.71 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  43.44 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  43.06 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  43.06 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  42.4 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  41.28 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  40.37 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  41.83 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  42.62 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  42.13 
 
 		 444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  42.04 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  42.59 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  41.24 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  42.82 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  43.12 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  41.01 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  39.21 
 
 		 445 aa  312  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  42.29 
 
 		 444 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  41.43 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  38.52 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  39.01 
 
 		 444 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  37.56 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  38.41 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  38.57 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  38.16 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  39.36 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  38 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.75 
 
 		 418 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.03 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.5 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  33.83 
 
 		 405 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  35.32 
 
 		 455 aa  226  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  32.64 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.53 
 
 		 488 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  33.41 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.24 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.33 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.58 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.2 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  35.34 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.35 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  33.99 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.98 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  32.13 
 
 		 461 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  35.47 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  31.24 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  31.13 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  33.33 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.78 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  31.62 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  31.62 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  31.77 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.53 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  31.53 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>