More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0553 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  925    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  66.59 
 
 		 446 aa  621  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  62.92 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  64.13 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  61.88 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  57.17 
 
 		 445 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  57.43 
 
 		 453 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  53.01 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  54.93 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  54.04 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  53.22 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  52.68 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  52.21 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  53.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  53.1 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  50.79 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  48.99 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  48.67 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  48.1 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  48.74 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.59 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  44.84 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  44.84 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  43.37 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.99 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  44.15 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  44.15 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  43.44 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  41.57 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  41.7 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  39.24 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  38.44 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  37.74 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  37.74 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  36.94 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.9 
 
 		 453 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.62 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.62 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.28 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  36.6 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.62 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  35.81 
 
 		 444 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  35.92 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.28 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  35.43 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.3 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  34.15 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  34.89 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.27 
 
 		 446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  36.15 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  34.98 
 
 		 440 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  36.82 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.47 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.05 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.75 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  34.23 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  34.15 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  33.78 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  32.96 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.64 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.41 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.01 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  31.34 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  32.74 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.51 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  32.13 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.81 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.48 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.24 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.03 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.97 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  32.17 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  33.03 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  31.55 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.27 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.56 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.82 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  28.44 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  31.74 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  31.79 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  33.71 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.47 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  33.33 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  28.7 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  28.7 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  28.7 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  28.7 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.58 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.81 
 
 		 420 aa  186  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  31.8 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.14 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.18 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.7 
 
 		 453 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.56 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.47 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  28.29 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.1 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.25 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.25 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  31.6 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>