More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0668 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  100 
 
 
444 aa  910    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  71.01 
 
 
446 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  69.23 
 
 
442 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  70.88 
 
 
445 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  70.81 
 
 
444 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  69.68 
 
 
444 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  94.37 
 
 
444 aa  870    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  71.95 
 
 
444 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  70.59 
 
 
464 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  69.68 
 
 
444 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  71.88 
 
 
442 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  71.11 
 
 
446 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  99.77 
 
 
444 aa  908    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  72.36 
 
 
446 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  70.88 
 
 
445 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  73.29 
 
 
440 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  71.49 
 
 
446 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  76.19 
 
 
441 aa  723    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  70.59 
 
 
444 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.46 
 
 
445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  63.06 
 
 
445 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  63.12 
 
 
444 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  59.08 
 
 
441 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  56.04 
 
 
453 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  57.01 
 
 
465 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  55.94 
 
 
458 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  54.46 
 
 
456 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  54.46 
 
 
456 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  54.23 
 
 
456 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.26 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  45.7 
 
 
442 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  48.5 
 
 
439 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  42.76 
 
 
443 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  42.76 
 
 
443 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.76 
 
 
442 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  41.53 
 
 
439 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.61 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.61 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.78 
 
 
440 aa  319  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  39.15 
 
 
439 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40.95 
 
 
443 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  37.21 
 
 
469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  39.1 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  38.32 
 
 
453 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  39.28 
 
 
446 aa  292  9e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.16 
 
 
445 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  37.74 
 
 
446 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.9 
 
 
443 aa  286  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  36.89 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  35.14 
 
 
448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  36.1 
 
 
444 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  35.78 
 
 
444 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  37.58 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  35.91 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  36.53 
 
 
448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  38.5 
 
 
432 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  36.53 
 
 
449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  36.16 
 
 
449 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  34.69 
 
 
444 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  36.12 
 
 
445 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  35.59 
 
 
446 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.02 
 
 
457 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  37.11 
 
 
468 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  34.54 
 
 
445 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  35.21 
 
 
449 aa  249  9e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.57 
 
 
494 aa  247  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  34.38 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.71 
 
 
444 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  35.01 
 
 
455 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  35.76 
 
 
418 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.84 
 
 
440 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.82 
 
 
418 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  32.74 
 
 
461 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  36.18 
 
 
427 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.99 
 
 
420 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.89 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.53 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.75 
 
 
449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  33.41 
 
 
448 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  32.5 
 
 
405 aa  213  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.4 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.15 
 
 
431 aa  210  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.53 
 
 
426 aa  210  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.66 
 
 
428 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.66 
 
 
428 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.66 
 
 
428 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.83 
 
 
428 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  35.75 
 
 
423 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.44 
 
 
428 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.21 
 
 
428 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.44 
 
 
428 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.83 
 
 
428 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.44 
 
 
428 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.44 
 
 
428 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  31.59 
 
 
428 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.94 
 
 
399 aa  203  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  32.79 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  33.1 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.61 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>