More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3229 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  100 
 
 		 444 aa  927    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  63.82 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  64.13 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  61.71 
 
 		 443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  61.06 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  59.51 
 
 		 446 aa  554  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  59.15 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  57.11 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  56.31 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  54.81 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  52.91 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  54.34 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  52.24 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  53.86 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  53.33 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  53.86 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  53.44 
 
 		 449 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  52.58 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  51.24 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  51.01 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  41.8 
 
 		 437 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  41.8 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.36 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  41.53 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  41.04 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  41.4 
 
 		 440 aa  329  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40.81 
 
 		 443 aa  329  8e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  41.26 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  39.07 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.36 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.36 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  35.67 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  35.37 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  36.1 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  36.1 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  35.51 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.71 
 
 		 453 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  35.59 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  35.75 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.15 
 
 		 442 aa  273  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.62 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.83 
 
 		 440 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  35.96 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.68 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  33.94 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.16 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  34.32 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.15 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.96 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.01 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.33 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.01 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  34.84 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  34.54 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  34.54 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  33.93 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.31 
 
 		 456 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  33.56 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.3 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  34.39 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.78 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  32.76 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.33 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.12 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  28.22 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.36 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.91 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  32.36 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.21 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  28.34 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.29 
 
 		 468 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.9 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  29.9 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  30.22 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  31.58 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.56 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.98 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.37 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.84 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  32.81 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.85 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  30.63 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  30.39 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  30.39 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  30.39 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.23 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  30.95 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.25 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.58 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.67 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  29.2 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.12 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.05 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  27.74 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>