More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5385 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  100 
 
 		 445 aa  928    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  63.82 
 
 		 444 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  63.62 
 
 		 448 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  62.89 
 
 		 453 aa  588  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  59.33 
 
 		 443 aa  554  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  57.17 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  56.63 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  54.5 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  54.26 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  55.16 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  53.48 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  53.56 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  53.66 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  55.01 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  54.32 
 
 		 449 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  54.48 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  54.32 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  54.48 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  54.09 
 
 		 453 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  52.85 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.47 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.47 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.63 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.66 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40.36 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  41.53 
 
 		 440 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  40.55 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.72 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.72 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  42.47 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  39 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  37.78 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.61 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.61 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.61 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  36.28 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.91 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.91 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  35.45 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  35.68 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  37.39 
 
 		 446 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  36.65 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  36.65 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.96 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.52 
 
 		 444 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.43 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  35.6 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.89 
 
 		 441 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.39 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.75 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  36.05 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  36.43 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.53 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.91 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  36.51 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  36.43 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  35.54 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.84 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  33.63 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.1 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  34.59 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  33.11 
 
 		 442 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  32.13 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  34.25 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.87 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.07 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  33.48 
 
 		 439 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.07 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.2 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  30.04 
 
 		 455 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  28.9 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.67 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.18 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.24 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  33.18 
 
 		 423 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.04 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.81 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.72 
 
 		 424 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  31.72 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.27 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.7 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  32.43 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  31.84 
 
 		 461 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.09 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.65 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.65 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  29.2 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  29.63 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  29.63 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  29.63 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  29.4 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  30.89 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  30.48 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  29.86 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  29.4 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  29.4 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  29.4 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  29.4 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.59 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>