More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_983 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  96.25 
 
 		 427 aa  837    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  86.89 
 
 		 428 aa  744    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  100 
 
 		 436 aa  886    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.78 
 
 		 473 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  51.05 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.7 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.16 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.84 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.47 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.65 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  49.06 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  50.95 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.29 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.51 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.78 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  49.53 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.18 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  47.64 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.71 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 		 429 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.54 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.24 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  49.53 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.54 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.96 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  50.12 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.59 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.45 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.88 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.19 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.05 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.73 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  45.65 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.78 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.35 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.97 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  44.78 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  44.39 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.14 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  44.24 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  45.09 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  45.09 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  45.09 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.76 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  44.86 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  44.86 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  44.86 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  44.63 
 
 		 428 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  44.63 
 
 		 428 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  43.19 
 
 		 426 aa  348  9e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  44.39 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  44.63 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  43.66 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  44.33 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  43.52 
 
 		 447 aa  345  8.999999999999999e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  44.16 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  43.36 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  43.53 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  43.06 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.03 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.67 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.5 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.12 
 
 		 425 aa  332  9e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.57 
 
 		 447 aa  332  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  41.69 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  41.69 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  42.29 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  43.84 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  43.46 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  42 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  44.21 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  40 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.12 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.02 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  41.98 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  41.87 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.92 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  41.98 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41.31 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  43.17 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  40.42 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  41.67 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  40.77 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  42.59 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  41.42 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  42.62 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  42.52 
 
 		 425 aa  319  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  42.76 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  42.86 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  42.68 
 
 		 425 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  43.07 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  40.14 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>