More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0102 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  100 
 
 
428 aa  865    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  52.02 
 
 
422 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.32 
 
 
425 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.84 
 
 
425 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.13 
 
 
425 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.37 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.18 
 
 
424 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.57 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.64 
 
 
433 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  50.12 
 
 
425 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.99 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.76 
 
 
433 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  51.52 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.05 
 
 
429 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.96 
 
 
429 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  45.97 
 
 
426 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.7 
 
 
439 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  50.35 
 
 
431 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.73 
 
 
442 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.32 
 
 
428 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.98 
 
 
427 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  45.99 
 
 
436 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.45 
 
 
436 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.93 
 
 
434 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  46.75 
 
 
432 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  45.52 
 
 
433 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  44.66 
 
 
425 aa  364  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  44.31 
 
 
431 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.15 
 
 
441 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  44.81 
 
 
433 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  43.47 
 
 
431 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 
425 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  45.52 
 
 
433 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 
429 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.09 
 
 
433 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  44.6 
 
 
433 aa  359  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.53 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  44.94 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  45.43 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  43.53 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  44.1 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  41.71 
 
 
426 aa  356  5e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  45.45 
 
 
429 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 
433 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 
434 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.28 
 
 
434 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  43.39 
 
 
426 aa  349  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.76 
 
 
429 aa  349  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  44.34 
 
 
437 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 
430 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.15 
 
 
431 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.06 
 
 
430 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 
434 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.39 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  40.28 
 
 
423 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.67 
 
 
439 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  40.38 
 
 
447 aa  334  1e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.33 
 
 
438 aa  332  7.000000000000001e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.16 
 
 
434 aa  332  9e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.11 
 
 
428 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 
433 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.97 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.87 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  42.69 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.86 
 
 
447 aa  327  3e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.15 
 
 
448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  40.24 
 
 
459 aa  325  1e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 
429 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 
432 aa  323  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.9 
 
 
437 aa  322  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  43.26 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  40.38 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 
430 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.81 
 
 
425 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  44.29 
 
 
433 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  39.76 
 
 
424 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.11 
 
 
430 aa  317  3e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  39.19 
 
 
425 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  39.19 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  40.57 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.19 
 
 
425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 
426 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  39.44 
 
 
429 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  44.17 
 
 
432 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  42.06 
 
 
431 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  42.06 
 
 
431 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  42.06 
 
 
431 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  41.84 
 
 
423 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  41.76 
 
 
431 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.08 
 
 
423 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  41.57 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  40.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  40.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  42.32 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  40.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  40.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  40.09 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  42.19 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>