More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4347 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  92.72 
 
 		 433 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  85.58 
 
 		 434 aa  701    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 430 aa  843    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  83.26 
 
 		 433 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  81.56 
 
 		 434 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  85.34 
 
 		 434 aa  698    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  63.62 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  61.88 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  62.59 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  62.59 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  60.71 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  60.05 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  61.88 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.21 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  61.88 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  60.33 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.72 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  58.39 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  57.21 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.34 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  58.39 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  54.48 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  58.87 
 
 		 428 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  57.82 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  59.34 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  57.78 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  53.83 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.29 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  52.12 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.65 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  50.69 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.18 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  51.42 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.46 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.76 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  51.44 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.54 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.9 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.32 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.06 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  44.81 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.41 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  44.58 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  44.81 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.16 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  41.12 
 
 		 436 aa  325  9e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.12 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  43.32 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  43.85 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  43.32 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  45.09 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  44.96 
 
 		 425 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.91 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  42.96 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  42.49 
 
 		 425 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.59 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  43.55 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  44.24 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  44.58 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.38 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.25 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  42.69 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  44.96 
 
 		 425 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  44.96 
 
 		 425 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  44.73 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  41.98 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.26 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.5 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.82 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  43.87 
 
 		 425 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  42.89 
 
 		 427 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  40.47 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.9 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.3 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.95 
 
 		 442 aa  299  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  40.52 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  41.22 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.95 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  41.84 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  36.32 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  38.41 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  41.01 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>