More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2554 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 423 aa  846    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.16 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  73.16 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.16 
 
 		 424 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  67.89 
 
 		 436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  70.91 
 
 		 422 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  69.34 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.08 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  52.49 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  52.02 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  52 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  52.02 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  54.63 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  52.02 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.99 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.29 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  51.54 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.29 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  49.88 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.48 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  49.41 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  50.35 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  51.07 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  47.74 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  45.97 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  47.27 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  52.12 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  49.88 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.71 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  47.62 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  49.4 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  46.3 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.11 
 
 		 446 aa  355  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.63 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.96 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  41.09 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  37.06 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  35.46 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.53 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.52 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  42.03 
 
 		 409 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  36.79 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  36.07 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.83 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  38.59 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.48 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  37.62 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  39.33 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.7 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  38.35 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.15 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  38.59 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  38.64 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  36.94 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.02 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  39.02 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.44 
 
 		 441 aa  256  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  38.17 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.32 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  39.06 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.8 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  36.75 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.79 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.17 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  35.29 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.65 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.07 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  38.35 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  38.3 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.38 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  34.83 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  32.94 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  38.9 
 
 		 426 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  35.7 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  38.1 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.39 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  37.14 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.83 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  37.38 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  39.68 
 
 		 441 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  34.83 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.6 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.83 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  34.83 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.73 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>