More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0923 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  100 
 
 		 407 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  65.19 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  62.1 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.5 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.44 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.2 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.48 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.74 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.07 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.34 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.22 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  39.62 
 
 		 433 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  39.86 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  40.91 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.77 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  37.74 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.17 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  39.15 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.64 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  38.21 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  38.88 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  42.45 
 
 		 432 aa  266  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.81 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  41.05 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  39.62 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.35 
 
 		 428 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.33 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  39.85 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  39.62 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  39.36 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  41.49 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.12 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.29 
 
 		 424 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  35 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  37.53 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.57 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  36.43 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  37.26 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  39.27 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  35.78 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.77 
 
 		 425 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  35.29 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  33.66 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  37.01 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.7 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  37.59 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.72 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  36.69 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.29 
 
 		 428 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.55 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  35.24 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.24 
 
 		 425 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.09 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  37.47 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  36.6 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  36.84 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.24 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  33.96 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  36.58 
 
 		 425 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  37.02 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  34.52 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  36.84 
 
 		 426 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  36.99 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  34 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.87 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  36.34 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.83 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  36.77 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  36.97 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  36.97 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  38.5 
 
 		 427 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.49 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  33.49 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.46 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  38.15 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.5 
 
 		 433 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  36.88 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  31.85 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  38.23 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  36.46 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  35.23 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.2 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.86 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.71 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  37.02 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  36.78 
 
 		 425 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  36.78 
 
 		 425 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  33.57 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>