More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0543 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  100 
 
 		 425 aa  868    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.5 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  53.79 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  53.77 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  54.25 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  53.07 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  53.07 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  52.25 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  53.19 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  52.59 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  53.54 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.88 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  51.77 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.64 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  47.51 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  46.93 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.87 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.03 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.21 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  43.36 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  46.67 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  43.6 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  43.13 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.84 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  41.13 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  41.86 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  41.61 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  42.25 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  41.37 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  41.13 
 
 		 425 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  41.78 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  41.75 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  40.8 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  41 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  40.76 
 
 		 425 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  41.84 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  40 
 
 		 431 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  41.61 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  40 
 
 		 431 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  40.57 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  41.84 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  41.84 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  41.98 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  41.13 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  40.28 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.06 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  39.68 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  41.71 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  43.58 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.06 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.83 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  38.97 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.03 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 		 424 aa  306  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  43.75 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  40.47 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  41.04 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  38.44 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  41.84 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.95 
 
 		 422 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  41.01 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  39.81 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.85 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  39.9 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.93 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.48 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.74 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  35.6 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  39.44 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  36.85 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  36.64 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  37.24 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  35.39 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  33.72 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.78 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.48 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.34 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  39.24 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  34.19 
 
 		 433 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  37.09 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.64 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  39.31 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  33.49 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.24 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  37.32 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.85 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.37 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  36.85 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  34.89 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.47 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>