More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0709 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  100 
 
 		 439 aa  861    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  73.9 
 
 		 431 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  75.46 
 
 		 446 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  81.51 
 
 		 441 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  77.14 
 
 		 431 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  75.75 
 
 		 431 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  73.9 
 
 		 431 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  73.21 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  71.99 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  73.84 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  71.66 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  66.13 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  65.67 
 
 		 425 aa  564  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  65.67 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  65.44 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  66.59 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  65.05 
 
 		 425 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  66.36 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  63.82 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  64.52 
 
 		 425 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  64.3 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  64.53 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  63.51 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  64.75 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  64.75 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  64.06 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  64.75 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  64.58 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  61.29 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  58.16 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  57.67 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  56.81 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  51.95 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  44.83 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 		 426 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  47.67 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.53 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  45.62 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  44.68 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.4 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.11 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.75 
 
 		 427 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  46.08 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  45.52 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  45.29 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  45.29 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  44.57 
 
 		 423 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.8 
 
 		 423 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  45.52 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  42.99 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  44.37 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  43.55 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.32 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.32 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  42.86 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  39.31 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.36 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.19 
 
 		 433 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.84 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.86 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.84 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  41.2 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.9 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.82 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.69 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  39.86 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  39.45 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.97 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  41.61 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.04 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.97 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.28 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  40.23 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  40.83 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  40.83 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.56 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  40.55 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  41.1 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  40.69 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.72 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.83 
 
 		 428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.64 
 
 		 424 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.41 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  37.44 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  38.62 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  41.63 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.25 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.69 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  40.87 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.91 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  39.31 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>