More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2311 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  77.65 
 
 		 425 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  97.88 
 
 		 424 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  79.2 
 
 		 425 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  76.01 
 
 		 422 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.29 
 
 		 425 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 425 aa  858    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  70.69 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  60.28 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  58.29 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.37 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.81 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.92 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.65 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.36 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.52 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  52.84 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.01 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.49 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.94 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.72 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  52.58 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  52.71 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  50.47 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  49.76 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.4 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  49.06 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  47.18 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  47.18 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  48.71 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.88 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  47.2 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.57 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  48.12 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.76 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  46.56 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.18 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  46.65 
 
 		 425 aa  385  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  46.23 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.14 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.56 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.43 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.71 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.2 
 
 		 430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 		 438 aa  360  4e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.89 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  45.28 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.74 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.34 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.65 
 
 		 448 aa  352  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.95 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  43.66 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  44.5 
 
 		 459 aa  348  7e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  40.98 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  44.24 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.89 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  43.29 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  41.75 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.89 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  41.75 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  41.75 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  41.75 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.84 
 
 		 419 aa  338  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  45.41 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  41.98 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  44 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  43.29 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  43.29 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  44.84 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  43.29 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  43.3 
 
 		 432 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  41.47 
 
 		 425 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  41.04 
 
 		 428 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  41.98 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  41.47 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  41.04 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  41.98 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  41.04 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  42.79 
 
 		 440 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 		 419 aa  332  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41.71 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.96 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  41.75 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  45.93 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 		 437 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  40.8 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  41.51 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  45.19 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  41.78 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.02 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>