More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1870 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 420 aa  858    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  64.27 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  64.03 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  62.47 
 
 		 426 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.47 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.9 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  44.98 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.73 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  42.08 
 
 		 426 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.04 
 
 		 436 aa  332  6e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.02 
 
 		 425 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 		 429 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.55 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  43.46 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.88 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  38.12 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  39.56 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.44 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.82 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  38.65 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.01 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  42.52 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.09 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.41 
 
 		 429 aa  288  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.67 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.16 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  41 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.81 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.06 
 
 		 430 aa  282  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.16 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.57 
 
 		 436 aa  278  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.11 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.22 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 		 473 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  39.76 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  39.76 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  39.76 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  41.91 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  41.22 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  38.66 
 
 		 429 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.75 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.56 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.75 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  35.84 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  40.1 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.1 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.87 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.3 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.49 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  39.15 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.24 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.76 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  40 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  39.27 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  41.23 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  39.27 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  40.1 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  37.59 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  38.63 
 
 		 435 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  39.95 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  37.37 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.43 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.94 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  37.79 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  41.3 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  36.72 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  35.15 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  39.66 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.95 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.5 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.31 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  38.83 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  36.47 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  37.85 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  34.66 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  38.57 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  40 
 
 		 432 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  38.28 
 
 		 448 aa  252  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  38.52 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.92 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.97 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  39.2 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  38.82 
 
 		 432 aa  249  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  38.55 
 
 		 425 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  35.53 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>